More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3606 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3606  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 395 aa  768    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.6 
 
 		 1370 aa  190  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  46.18 
 
 		 828 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.18 
 
 		 1361 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.09 
 
 		 1390 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.09 
 
 		 1390 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.09 
 
 		 1390 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.71 
 
 		 1385 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  43.89 
 
 		 851 aa  176  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.8 
 
 		 1248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 		 1383 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.21 
 
 		 1711 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.22 
 
 		 1051 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4619  putative PAS/PAC sensor protein  41.92 
 
 		 409 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  47.29 
 
 		 757 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  39.11 
 
 		 572 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  36 
 
 		 573 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  37.27 
 
 		 1017 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  38.87 
 
 		 614 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  36.3 
 
 		 744 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  34.56 
 
 		 753 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  35.14 
 
 		 817 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  38.5 
 
 		 713 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4640  putative PAS/PAC sensor protein  38.75 
 
 		 427 aa  113  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.74459  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  36.7 
 
 		 866 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.15 
 
 		 523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  36.75 
 
 		 685 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  34.78 
 
 		 574 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.89 
 
 		 1045 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  39.32 
 
 		 745 aa  110  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  35.93 
 
 		 607 aa  109  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  36.98 
 
 		 770 aa  109  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2114  anti-sigma-factor antagonist  40.49 
 
 		 618 aa  109  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39314  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  37.12 
 
 		 562 aa  109  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  32.17 
 
 		 754 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  33.83 
 
 		 743 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  35.94 
 
 		 1039 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  33.1 
 
 		 932 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2019  protein serine/threonine phosphatase  38.81 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  40.08 
 
 		 570 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  47.97 
 
 		 738 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  34.98 
 
 		 692 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  41.01 
 
 		 643 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  33.19 
 
 		 537 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  37.19 
 
 		 672 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  41.01 
 
 		 594 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0750  putative PAS/PAC sensor protein  36.07 
 
 		 546 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.0245877 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  41.28 
 
 		 772 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  33.45 
 
 		 765 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  43.54 
 
 		 544 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0433  putative PAS/PAC sensor protein  37.59 
 
 		 627 aa  103  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546697  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  32.36 
 
 		 688 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.51 
 
 		 579 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  34.34 
 
 		 697 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  36.48 
 
 		 722 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.94 
 
 		 750 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.92 
 
 		 775 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  41.38 
 
 		 1432 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  35.2 
 
 		 721 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  36.57 
 
 		 956 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  34.38 
 
 		 865 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  36.78 
 
 		 547 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  38.89 
 
 		 1225 aa  100  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11810  PAS domain S-box  35.48 
 
 		 502 aa  100  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  32.31 
 
 		 697 aa  99.8  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  39.11 
 
 		 591 aa  99.8  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  35.68 
 
 		 676 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  37.56 
 
 		 700 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.87 
 
 		 525 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1986  putative GAF sensor protein  36.03 
 
 		 798 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.932658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  33.46 
 
 		 723 aa  98.6  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0106  PAS protein phosphatase 2C-like  35.25 
 
 		 670 aa  97.8  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.84 
 
 		 576 aa  97.4  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  36.68 
 
 		 716 aa  97.1  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.53 
 
 		 847 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.52 
 
 		 553 aa  96.7  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8305  putative PAS/PAC sensor protein  33.22 
 
 		 528 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  35.27 
 
 		 688 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  41.53 
 
 		 760 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  35.53 
 
 		 693 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  35.47 
 
 		 607 aa  94  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13090  Stage II sporulation protein E (SpoIIE)  29.26 
 
 		 576 aa  94  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06030  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  31.85 
 
 		 567 aa  93.6  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486099  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  35.09 
 
 		 438 aa  93.6  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.61 
 
 		 952 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  31.85 
 
 		 930 aa  93.2  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32 
 
 		 529 aa  93.2  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6994  putative PAS/PAC sensor protein  33.91 
 
 		 797 aa  93.2  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  29.92 
 
 		 618 aa  92.8  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  30.99 
 
 		 771 aa  92  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.77 
 
 		 583 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  36 
 
 		 746 aa  91.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  32.87 
 
 		 730 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  36.63 
 
 		 260 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0659  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.64 
 
 		 450 aa  90.5  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 652 aa  89.7  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  36.33 
 
 		 855 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  38.22 
 
 		 692 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.76 
 
 		 738 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2742  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.09 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0101851  normal  0.919668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>