More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35220 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  51.39 
 
 
745 aa  645    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  100 
 
 
771 aa  1494    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  51.16 
 
 
716 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  46.01 
 
 
693 aa  468  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  43.19 
 
 
746 aa  414  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4122  Stage II sporulation E family protein  50.56 
 
 
805 aa  350  7e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.530219  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  32.3 
 
 
760 aa  194  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  30.64 
 
 
723 aa  178  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  31.57 
 
 
570 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  32.06 
 
 
817 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.69 
 
 
573 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.64 
 
 
1045 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  36.08 
 
 
574 aa  159  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.49 
 
 
616 aa  157  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.63 
 
 
553 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  31.26 
 
 
591 aa  152  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  30.91 
 
 
697 aa  152  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.92 
 
 
738 aa  152  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  32.51 
 
 
1039 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0617  putative PAS/PAC sensor protein  30.37 
 
 
580 aa  148  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  30.21 
 
 
744 aa  146  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
1711 aa  143  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  37.75 
 
 
865 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  30.14 
 
 
855 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  29.17 
 
 
754 aa  142  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  31.29 
 
 
1432 aa  141  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  39.85 
 
 
770 aa  141  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.48 
 
 
1051 aa  140  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.06 
 
 
579 aa  140  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.09 
 
 
952 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  37.46 
 
 
583 aa  139  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  33.01 
 
 
618 aa  138  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  40.14 
 
 
614 aa  138  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.83 
 
 
549 aa  137  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  29.34 
 
 
753 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06030  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  38.81 
 
 
567 aa  136  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486099  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  35.42 
 
 
932 aa  136  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0433  putative PAS/PAC sensor protein  35.69 
 
 
627 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546697  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13090  Stage II sporulation protein E (SpoIIE)  35.14 
 
 
576 aa  135  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  35.94 
 
 
866 aa  134  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  33.55 
 
 
692 aa  134  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  37.89 
 
 
607 aa  134  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  37.41 
 
 
652 aa  134  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  33.45 
 
 
585 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.06 
 
 
775 aa  133  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.07 
 
 
692 aa  132  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0106  PAS protein phosphatase 2C-like  32.65 
 
 
670 aa  130  9.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  28.63 
 
 
765 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.11 
 
 
576 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4640  putative PAS/PAC sensor protein  36.11 
 
 
427 aa  127  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.74459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.51 
 
 
743 aa  127  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  31.42 
 
 
713 aa  126  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  37.25 
 
 
956 aa  127  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  32.17 
 
 
688 aa  125  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.76 
 
 
1390 aa  124  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.76 
 
 
1390 aa  124  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.76 
 
 
1390 aa  124  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0750  putative PAS/PAC sensor protein  36.92 
 
 
546 aa  124  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.0245877 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  33.12 
 
 
607 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  34.12 
 
 
547 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  34.84 
 
 
930 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  31.77 
 
 
1017 aa  122  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  34.3 
 
 
562 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  34.93 
 
 
685 aa  120  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0207  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.88 
 
 
613 aa  119  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  34.9 
 
 
572 aa  117  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  32.27 
 
 
700 aa  117  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  30.08 
 
 
776 aa  117  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  34.22 
 
 
260 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  31.4 
 
 
722 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  36.9 
 
 
544 aa  116  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  31.21 
 
 
453 aa  115  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  32.29 
 
 
693 aa  114  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.58 
 
 
523 aa  114  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  27.99 
 
 
537 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.16 
 
 
525 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  31.85 
 
 
688 aa  113  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0659  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.56 
 
 
450 aa  111  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808889  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 
1361 aa  111  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  28.82 
 
 
1225 aa  110  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.07 
 
 
697 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  28.73 
 
 
851 aa  109  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  34.49 
 
 
730 aa  108  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6994  putative PAS/PAC sensor protein  32.82 
 
 
797 aa  108  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126059  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  28.02 
 
 
828 aa  107  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.23 
 
 
560 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 
1248 aa  107  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
1385 aa  105  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  32.51 
 
 
693 aa  104  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
1370 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  30.94 
 
 
694 aa  102  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8305  putative PAS/PAC sensor protein  31.05 
 
 
528 aa  102  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2798  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.53 
 
 
538 aa  101  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  30.14 
 
 
709 aa  101  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.82 
 
 
529 aa  101  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  30.04 
 
 
721 aa  100  8e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  31.96 
 
 
743 aa  100  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3606  protein serine/threonine phosphatase  32 
 
 
395 aa  99.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  31.85 
 
 
713 aa  99  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1986  putative GAF sensor protein  33.33 
 
 
798 aa  99  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.932658  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>