More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0106 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0106  PAS protein phosphatase 2C-like  100 
 
 
670 aa  1363    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  45.04 
 
 
692 aa  532  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  33.12 
 
 
574 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  30.98 
 
 
688 aa  213  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.48 
 
 
697 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  32.79 
 
 
618 aa  197  6e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  34.34 
 
 
607 aa  197  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  30.07 
 
 
700 aa  196  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  31.91 
 
 
585 aa  192  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  35.73 
 
 
865 aa  191  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  33.76 
 
 
583 aa  183  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  30.28 
 
 
693 aa  183  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  28.74 
 
 
692 aa  182  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  29.5 
 
 
723 aa  179  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  33.1 
 
 
760 aa  179  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  32.19 
 
 
607 aa  178  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
547 aa  176  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  42.59 
 
 
770 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  37.09 
 
 
562 aa  174  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0750  putative PAS/PAC sensor protein  38.12 
 
 
546 aa  171  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.0245877 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  31.63 
 
 
866 aa  169  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  39.79 
 
 
544 aa  168  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  39.46 
 
 
685 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  32.03 
 
 
932 aa  164  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4640  putative PAS/PAC sensor protein  44.44 
 
 
427 aa  164  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.74459  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  37.11 
 
 
614 aa  163  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.45 
 
 
553 aa  163  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  38.31 
 
 
652 aa  160  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.59 
 
 
576 aa  154  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13090  Stage II sporulation protein E (SpoIIE)  36.49 
 
 
576 aa  153  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  38.2 
 
 
956 aa  151  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  33.97 
 
 
572 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  40.38 
 
 
523 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.12 
 
 
775 aa  147  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  31.48 
 
 
730 aa  146  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0659  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.54 
 
 
450 aa  145  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808889  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  36.26 
 
 
745 aa  143  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  31.12 
 
 
722 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  32.45 
 
 
1432 aa  140  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  30.33 
 
 
753 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  28.63 
 
 
765 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 
1390 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 
1390 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 
1390 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2019  protein serine/threonine phosphatase  36.46 
 
 
308 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.71 
 
 
525 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0433  putative PAS/PAC sensor protein  35.42 
 
 
627 aa  134  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546697  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  29.98 
 
 
817 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  37.92 
 
 
930 aa  133  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  30.06 
 
 
713 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  31.47 
 
 
1039 aa  131  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
1385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06030  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  34.27 
 
 
567 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486099  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  34.42 
 
 
828 aa  128  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  33.33 
 
 
851 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.63 
 
 
529 aa  127  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  29 
 
 
570 aa  127  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 
1248 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.56 
 
 
1045 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  40.59 
 
 
260 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  28.35 
 
 
754 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
1361 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.46 
 
 
1051 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  34.21 
 
 
746 aa  121  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  29 
 
 
594 aa  120  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  26.74 
 
 
688 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0617  putative PAS/PAC sensor protein  33.22 
 
 
580 aa  118  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  30.34 
 
 
1225 aa  117  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  26.84 
 
 
744 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  33.91 
 
 
643 aa  115  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  33.19 
 
 
453 aa  114  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 
1370 aa  114  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.5 
 
 
560 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.4 
 
 
573 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  33.2 
 
 
716 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  33.44 
 
 
693 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  33.33 
 
 
771 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  30.26 
 
 
721 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  28.15 
 
 
757 aa  110  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.89 
 
 
583 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  27.07 
 
 
743 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
1383 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.99 
 
 
616 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  28.46 
 
 
697 aa  108  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0207  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.9 
 
 
613 aa  108  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  32.19 
 
 
537 aa  107  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2798  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.88 
 
 
538 aa  107  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
1711 aa  106  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0169  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.74 
 
 
711 aa  107  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00160079  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  28.25 
 
 
591 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.47 
 
 
738 aa  105  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  33.85 
 
 
1017 aa  103  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  32.45 
 
 
713 aa  103  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.97 
 
 
579 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.26 
 
 
952 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6792  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.74 
 
 
585 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  33.88 
 
 
772 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4619  putative PAS/PAC sensor protein  34.57 
 
 
409 aa  101  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  25.96 
 
 
853 aa  100  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3329  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.53 
 
 
830 aa  99.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>