More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5315 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  100 
 
 
750 aa  1450    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  66.67 
 
 
713 aa  491  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  39.09 
 
 
776 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  34.78 
 
 
591 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40.94 
 
 
952 aa  197  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  38.73 
 
 
573 aa  194  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.79 
 
 
616 aa  191  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  34.89 
 
 
721 aa  189  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  34.79 
 
 
817 aa  187  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  34.61 
 
 
744 aa  188  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  33.41 
 
 
753 aa  187  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  43.51 
 
 
643 aa  186  9e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  37.25 
 
 
760 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  43.51 
 
 
594 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  35.25 
 
 
765 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.33 
 
 
579 aa  181  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  37.31 
 
 
743 aa  180  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  35.99 
 
 
1039 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40.53 
 
 
1045 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  40.22 
 
 
697 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  33.1 
 
 
713 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  32.72 
 
 
574 aa  173  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  32.3 
 
 
754 aa  173  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  35.97 
 
 
757 aa  173  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 
1711 aa  171  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  41.27 
 
 
855 aa  171  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  37.78 
 
 
685 aa  170  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  41.13 
 
 
693 aa  165  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  36.2 
 
 
562 aa  164  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  41.33 
 
 
1225 aa  163  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  33.77 
 
 
607 aa  163  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  39.84 
 
 
697 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.09 
 
 
688 aa  162  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  38.43 
 
 
692 aa  162  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  39.57 
 
 
688 aa  161  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6792  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.98 
 
 
585 aa  160  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  37.6 
 
 
688 aa  159  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  38.82 
 
 
700 aa  158  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  41.57 
 
 
1432 aa  157  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  33.25 
 
 
866 aa  156  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.99 
 
 
553 aa  154  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  31.96 
 
 
618 aa  153  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  41.96 
 
 
560 aa  153  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  36.96 
 
 
537 aa  152  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  34.67 
 
 
607 aa  151  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  31.7 
 
 
676 aa  152  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  33.5 
 
 
583 aa  150  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  32.47 
 
 
585 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  32.53 
 
 
547 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  32.72 
 
 
570 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  32.89 
 
 
730 aa  148  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 
1361 aa  148  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 
1370 aa  148  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  31.28 
 
 
932 aa  147  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  30.9 
 
 
709 aa  146  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 
1385 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  31.7 
 
 
865 aa  143  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.55 
 
 
728 aa  142  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  31.28 
 
 
694 aa  142  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  32.36 
 
 
743 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  32.13 
 
 
722 aa  141  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0617  putative PAS/PAC sensor protein  37.55 
 
 
580 aa  140  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  32.14 
 
 
512 aa  140  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  38.78 
 
 
544 aa  139  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  38.33 
 
 
851 aa  139  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0169  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.6 
 
 
711 aa  138  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00160079  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  33.25 
 
 
723 aa  139  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.73 
 
 
583 aa  138  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  39.37 
 
 
828 aa  137  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  33.98 
 
 
956 aa  137  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.96 
 
 
702 aa  136  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.78 
 
 
738 aa  135  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 
1390 aa  135  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 
1390 aa  135  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 
1390 aa  135  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  37.15 
 
 
453 aa  134  7.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  30.75 
 
 
693 aa  134  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  32.05 
 
 
581 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  39.9 
 
 
672 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
800 aa  133  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.56 
 
 
1051 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 
1248 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0659  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.98 
 
 
450 aa  131  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808889  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  40 
 
 
529 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  40.69 
 
 
772 aa  127  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0433  putative PAS/PAC sensor protein  35.14 
 
 
627 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546697  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  32.19 
 
 
572 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  29.44 
 
 
930 aa  125  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.65 
 
 
655 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  37.55 
 
 
614 aa  125  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  42.27 
 
 
1017 aa  124  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  36.5 
 
 
525 aa  122  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  44.85 
 
 
260 aa  122  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.38 
 
 
1332 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  38.46 
 
 
745 aa  121  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.16 
 
 
576 aa  120  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  34.22 
 
 
716 aa  120  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  29.32 
 
 
438 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  42.7 
 
 
467 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.55 
 
 
775 aa  117  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>