More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4098 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  100 
 
 
1045 aa  2066    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  51.12 
 
 
817 aa  500  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  44.56 
 
 
573 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  41.84 
 
 
697 aa  393  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  42.88 
 
 
616 aa  353  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  41.96 
 
 
855 aa  351  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  42.88 
 
 
1039 aa  350  7e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  41.84 
 
 
579 aa  349  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  37.87 
 
 
591 aa  323  8e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  40.21 
 
 
713 aa  285  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.39 
 
 
952 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  39.79 
 
 
1432 aa  251  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  37.24 
 
 
722 aa  239  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  33.28 
 
 
754 aa  229  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  40.52 
 
 
1225 aa  228  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  32.85 
 
 
744 aa  227  8e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  32.6 
 
 
753 aa  226  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  37.07 
 
 
688 aa  221  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  31.5 
 
 
765 aa  218  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  36.33 
 
 
776 aa  217  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.32 
 
 
583 aa  207  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.63 
 
 
743 aa  200  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  38.29 
 
 
594 aa  198  6e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  45.17 
 
 
643 aa  194  7e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.12 
 
 
738 aa  181  7e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  41.22 
 
 
713 aa  175  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.35 
 
 
750 aa  169  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  34.52 
 
 
745 aa  162  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  33.5 
 
 
716 aa  161  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  35.94 
 
 
757 aa  159  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  34.71 
 
 
760 aa  159  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.04 
 
 
549 aa  158  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  35.32 
 
 
537 aa  158  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  31.89 
 
 
574 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8305  putative PAS/PAC sensor protein  35.38 
 
 
528 aa  155  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  39.06 
 
 
685 aa  153  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  36.45 
 
 
721 aa  153  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  42.21 
 
 
560 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  33.41 
 
 
932 aa  150  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0377  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.92 
 
 
1021 aa  148  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.540198 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1836  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  41.21 
 
 
601 aa  148  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  32.4 
 
 
771 aa  147  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  34.09 
 
 
693 aa  145  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  34.38 
 
 
723 aa  144  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  32.35 
 
 
583 aa  143  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  34.85 
 
 
547 aa  142  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  36.42 
 
 
865 aa  142  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  33.48 
 
 
866 aa  142  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  35.89 
 
 
700 aa  140  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  30.47 
 
 
607 aa  139  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4122  Stage II sporulation E family protein  35.04 
 
 
805 aa  140  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.530219  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  33.18 
 
 
730 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3559  helix-turn-helix Fis-type  39.8 
 
 
590 aa  139  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0123539  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2114  anti-sigma-factor antagonist  40.56 
 
 
618 aa  138  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39314  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  35.91 
 
 
688 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  35.28 
 
 
692 aa  134  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  31.39 
 
 
607 aa  134  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.56 
 
 
529 aa  132  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  34.33 
 
 
453 aa  131  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  37.13 
 
 
570 aa  131  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.95 
 
 
523 aa  131  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  36.78 
 
 
697 aa  130  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  37.55 
 
 
672 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0617  putative PAS/PAC sensor protein  36.51 
 
 
580 aa  130  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.52 
 
 
692 aa  130  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4895  Fis family transcriptional regulator  31.29 
 
 
615 aa  128  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695547  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  31.14 
 
 
562 aa  128  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  30.63 
 
 
930 aa  128  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0106  PAS protein phosphatase 2C-like  29.82 
 
 
670 aa  127  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.58 
 
 
1051 aa  127  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  38.79 
 
 
828 aa  127  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  34.29 
 
 
693 aa  127  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0087  helix-turn-helix Fis-type  37.77 
 
 
588 aa  127  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2510  transcriptional regulator  32.75 
 
 
615 aa  126  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.583312  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 
1385 aa  127  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  37.6 
 
 
676 aa  125  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 
1248 aa  125  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2523  diguanylate cyclase  37.28 
 
 
587 aa  124  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  29.58 
 
 
746 aa  123  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  38.66 
 
 
702 aa  123  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 
544 aa  123  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  36 
 
 
1017 aa  123  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
1361 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
1370 aa  122  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  40.18 
 
 
772 aa  122  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.79 
 
 
847 aa  121  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6792  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  41.62 
 
 
585 aa  121  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  33.94 
 
 
709 aa  120  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  32.45 
 
 
618 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  34.74 
 
 
512 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  36.43 
 
 
851 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2798  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.12 
 
 
538 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  36 
 
 
572 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
1711 aa  119  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  34.44 
 
 
525 aa  119  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2019  protein serine/threonine phosphatase  35.62 
 
 
308 aa  119  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  34.95 
 
 
956 aa  118  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4619  putative PAS/PAC sensor protein  40.23 
 
 
409 aa  118  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  32.37 
 
 
585 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.24 
 
 
688 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>