More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3739 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  100 
 
 
523 aa  1021    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  49.43 
 
 
529 aa  402  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  46.64 
 
 
525 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2798  response regulator receiver modulated serine phosphatase  45.35 
 
 
538 aa  355  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.98 
 
 
1051 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  40.38 
 
 
693 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0106  PAS protein phosphatase 2C-like  40.38 
 
 
670 aa  151  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  39.93 
 
 
760 aa  148  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  42.32 
 
 
692 aa  147  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  36.74 
 
 
688 aa  143  9e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  43.4 
 
 
1017 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.26 
 
 
560 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.53 
 
 
616 aa  138  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  35.71 
 
 
453 aa  137  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  37.64 
 
 
574 aa  136  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.64 
 
 
697 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.33 
 
 
1045 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  40.74 
 
 
544 aa  134  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  36.98 
 
 
692 aa  133  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  35.02 
 
 
688 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  35.08 
 
 
709 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 
1711 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  38.03 
 
 
753 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  37.13 
 
 
1039 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  39.83 
 
 
260 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  36.22 
 
 
643 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  33.94 
 
 
700 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  36.22 
 
 
594 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  32.33 
 
 
745 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  36.88 
 
 
765 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 
1390 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 
1390 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 
1390 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  35.58 
 
 
676 aa  127  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  37.41 
 
 
607 aa  126  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3329  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.94 
 
 
830 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  37.74 
 
 
585 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  32.39 
 
 
721 aa  125  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  36.82 
 
 
573 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  35.83 
 
 
697 aa  124  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  36.55 
 
 
713 aa  123  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  32.41 
 
 
716 aa  123  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  36.36 
 
 
828 aa  123  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.29 
 
 
579 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  32.61 
 
 
817 aa  121  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 
1248 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
1385 aa  120  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  38.55 
 
 
702 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  37.6 
 
 
738 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  37.74 
 
 
757 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6792  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40.51 
 
 
585 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
1361 aa  118  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  38.7 
 
 
562 aa  118  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  35.09 
 
 
851 aa  117  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.5 
 
 
583 aa  117  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  38.05 
 
 
713 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 
583 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  38.46 
 
 
652 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  33.46 
 
 
618 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  31.56 
 
 
591 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3138  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.72 
 
 
647 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.17 
 
 
738 aa  114  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  37.01 
 
 
744 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  35.78 
 
 
672 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0750  putative PAS/PAC sensor protein  39.61 
 
 
546 aa  113  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.0245877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  32.97 
 
 
776 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3606  protein serine/threonine phosphatase  37.01 
 
 
395 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.61 
 
 
750 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  36.03 
 
 
865 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  35.27 
 
 
607 aa  109  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40.56 
 
 
549 aa  109  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  33.71 
 
 
855 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
1383 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11810  PAS domain S-box  34.63 
 
 
502 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85834  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.02 
 
 
553 aa  108  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  38.38 
 
 
547 aa  108  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0659  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.83 
 
 
450 aa  108  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808889  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4406  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.15 
 
 
653 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 
663 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  31.06 
 
 
693 aa  107  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4619  putative PAS/PAC sensor protein  38.84 
 
 
409 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
1370 aa  107  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.93 
 
 
663 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.296509  normal  0.022202 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2411  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 
497 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0169  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.82 
 
 
711 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00160079  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  34.62 
 
 
694 aa  105  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  33.21 
 
 
437 aa  104  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  34.7 
 
 
537 aa  104  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  34.2 
 
 
723 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4252  response regulator receiver protein  48.67 
 
 
151 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.824205  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0433  putative PAS/PAC sensor protein  37.6 
 
 
627 aa  103  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546697  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3458  putative PAS/PAC sensor protein  38.14 
 
 
760 aa  103  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0932578 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1818  protein serine/threonine phosphatase  34.18 
 
 
309 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23057  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  30.48 
 
 
771 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  30.77 
 
 
746 aa  102  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  32.96 
 
 
1432 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2742  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.27 
 
 
438 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0101851  normal  0.919668 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  35.47 
 
 
772 aa  101  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  34.24 
 
 
570 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4640  putative PAS/PAC sensor protein  35.92 
 
 
427 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.74459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>