More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1739 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  100 
 
 
817 aa  1647    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  50.6 
 
 
1045 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  41.22 
 
 
697 aa  398  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  43.67 
 
 
616 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  34.62 
 
 
855 aa  385  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  44.64 
 
 
1039 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  40.73 
 
 
573 aa  382  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  39.51 
 
 
591 aa  360  6e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.61 
 
 
579 aa  340  8e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  33.28 
 
 
713 aa  291  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  31.09 
 
 
688 aa  281  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.13 
 
 
952 aa  264  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  34.41 
 
 
722 aa  252  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  33.7 
 
 
776 aa  245  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  30.78 
 
 
753 aa  237  6e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.49 
 
 
583 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  36.83 
 
 
1432 aa  235  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  31.01 
 
 
744 aa  231  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.33 
 
 
743 aa  231  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  30.78 
 
 
754 aa  230  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  30.38 
 
 
765 aa  226  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  37.94 
 
 
1225 aa  224  6e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  31.8 
 
 
594 aa  207  6e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  36.3 
 
 
713 aa  187  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  39.36 
 
 
643 aa  182  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  32.82 
 
 
745 aa  180  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8305  putative PAS/PAC sensor protein  33.12 
 
 
528 aa  177  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.34 
 
 
738 aa  174  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  32.46 
 
 
760 aa  172  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.47 
 
 
750 aa  172  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  27.34 
 
 
716 aa  169  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  31.35 
 
 
574 aa  167  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  33.56 
 
 
723 aa  164  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  31.63 
 
 
865 aa  163  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  29.6 
 
 
866 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.26 
 
 
549 aa  159  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  31.19 
 
 
771 aa  157  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  32.95 
 
 
537 aa  157  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40 
 
 
560 aa  156  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  37.33 
 
 
709 aa  155  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  33.75 
 
 
721 aa  154  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  36.98 
 
 
685 aa  153  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  27.99 
 
 
570 aa  152  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  35.1 
 
 
453 aa  152  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
1711 aa  151  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2798  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.88 
 
 
538 aa  150  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  35.8 
 
 
607 aa  150  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  34.84 
 
 
697 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  30.19 
 
 
688 aa  148  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  33.12 
 
 
700 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  28.93 
 
 
932 aa  148  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  31.99 
 
 
693 aa  148  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4122  Stage II sporulation E family protein  32.95 
 
 
805 aa  147  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.530219  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  30.13 
 
 
562 aa  147  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  27.57 
 
 
930 aa  147  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  31.51 
 
 
757 aa  146  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  29.37 
 
 
585 aa  144  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
1385 aa  144  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  34.12 
 
 
702 aa  144  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  31.65 
 
 
692 aa  143  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6792  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40.67 
 
 
585 aa  142  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  29.46 
 
 
583 aa  141  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0617  putative PAS/PAC sensor protein  32.14 
 
 
580 aa  141  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  30.33 
 
 
607 aa  141  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  28.81 
 
 
544 aa  140  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  33.9 
 
 
672 aa  139  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.75 
 
 
553 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.86 
 
 
775 aa  139  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  32.69 
 
 
693 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  34.56 
 
 
618 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  32.39 
 
 
828 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
1361 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 
1248 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13090  Stage II sporulation protein E (SpoIIE)  35.25 
 
 
576 aa  135  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2019  protein serine/threonine phosphatase  37.13 
 
 
308 aa  134  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  35.13 
 
 
547 aa  134  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0106  PAS protein phosphatase 2C-like  29.98 
 
 
670 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  31.43 
 
 
581 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.4 
 
 
1051 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  27.2 
 
 
730 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  31.23 
 
 
851 aa  133  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  30.59 
 
 
572 aa  132  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0750  putative PAS/PAC sensor protein  28.65 
 
 
546 aa  131  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.0245877 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  29.68 
 
 
746 aa  130  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
1370 aa  130  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 
1390 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 
1390 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 
1390 aa  129  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  31.62 
 
 
1017 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  32.51 
 
 
956 aa  126  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  31.81 
 
 
676 aa  125  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.8 
 
 
576 aa  123  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4619  putative PAS/PAC sensor protein  37.16 
 
 
409 aa  122  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  33.57 
 
 
692 aa  121  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3458  putative PAS/PAC sensor protein  37.01 
 
 
760 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0932578 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  34.05 
 
 
743 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6994  putative PAS/PAC sensor protein  37.67 
 
 
797 aa  120  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126059  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.39 
 
 
1332 aa  120  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.46 
 
 
523 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.56 
 
 
525 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0874374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>