More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11810 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_11810  PAS domain S-box  100 
 
 		 502 aa  972    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  33.87 
 
 		 1017 aa  146  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.33 
 
 		 1051 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  39.48 
 
 		 453 aa  136  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  34.29 
 
 		 828 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.4 
 
 		 1045 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 		 1248 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 		 1711 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.44 
 
 		 560 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 1385 aa  120  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  36.92 
 
 		 574 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 1330 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  36.76 
 
 		 851 aa  117  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 1361 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  33.94 
 
 		 817 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  38.72 
 
 		 772 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.27 
 
 		 1390 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.27 
 
 		 1390 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.27 
 
 		 1390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  36.51 
 
 		 614 aa  114  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3329  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.33 
 
 		 830 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  38.26 
 
 		 770 aa  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  38.58 
 
 		 652 aa  113  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  35.2 
 
 		 607 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  36.07 
 
 		 697 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0617  putative PAS/PAC sensor protein  38.84 
 
 		 580 aa  111  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  34.31 
 
 		 693 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.29 
 
 		 702 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 688 aa  110  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.51 
 
 		 847 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13090  Stage II sporulation protein E (SpoIIE)  32.21 
 
 		 576 aa  110  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.66 
 
 		 549 aa  109  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  32.2 
 
 		 562 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1818  protein serine/threonine phosphatase  35.34 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.96 
 
 		 738 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  36.68 
 
 		 713 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.64 
 
 		 523 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  37.89 
 
 		 956 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.69 
 
 		 579 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.09 
 
 		 583 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8733  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.36 
 
 		 532 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  33.45 
 
 		 685 aa  107  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6994  putative PAS/PAC sensor protein  33.62 
 
 		 797 aa  107  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 1255 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  28.57 
 
 		 637 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  38.5 
 
 		 716 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  32.24 
 
 		 688 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  36.25 
 
 		 260 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  33.06 
 
 		 700 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  32.77 
 
 		 1039 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.9 
 
 		 728 aa  105  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  37.2 
 
 		 547 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11395  hypothetical protein  32.98 
 
 		 653 aa  104  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 1370 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  32.46 
 
 		 694 aa  104  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.38 
 
 		 692 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 866 aa  103  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3606  protein serine/threonine phosphatase  35.36 
 
 		 395 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  34.2 
 
 		 855 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  35.29 
 
 		 932 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06030  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  34.56 
 
 		 567 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486099  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  36.33 
 
 		 865 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.04 
 
 		 775 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0433  putative PAS/PAC sensor protein  35.77 
 
 		 627 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546697  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 		 1070 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4619  putative PAS/PAC sensor protein  31.9 
 
 		 409 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 1548 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  34.52 
 
 		 607 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 735 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  32.89 
 
 		 755 aa  100  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5079  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 695 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.929766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  32.17 
 
 		 697 aa  99.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1070 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1528  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 659 aa  99.4  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  34.11 
 
 		 572 aa  99.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2114  anti-sigma-factor antagonist  37.38 
 
 		 618 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39314  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  32.27 
 
 		 676 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5852  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  40.62 
 
 		 424 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910285  normal  0.678328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  27.92 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  37.14 
 
 		 1432 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  37.71 
 
 		 757 aa  98.2  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.29 
 
 		 573 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  30.89 
 
 		 692 aa  98.2  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  31.85 
 
 		 585 aa  97.4  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  37.45 
 
 		 581 aa  97.1  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  34.86 
 
 		 658 aa  97.1  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5090  protein serine/threonine phosphatase  32.92 
 
 		 487 aa  97.1  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290329  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  37.85 
 
 		 738 aa  97.1  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  29.79 
 
 		 591 aa  96.3  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  32.64 
 
 		 746 aa  95.9  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  34.47 
 
 		 721 aa  96.3  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  34.63 
 
 		 525 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  36.72 
 
 		 723 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  34.33 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  34.33 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2087  putative PAS/PAC sensor protein  32.24 
 
 		 666 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000976195  normal  0.0252685 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  32.39 
 
 		 437 aa  95.1  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  31.56 
 
 		 594 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  31.56 
 
 		 643 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  34.33 
 
 		 431 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>