More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1882 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
721 aa  1432    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  41.48 
 
 
757 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  32.7 
 
 
581 aa  185  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.86 
 
 
750 aa  181  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  33.55 
 
 
583 aa  179  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  35.8 
 
 
572 aa  174  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  34.47 
 
 
547 aa  169  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  32.97 
 
 
713 aa  167  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  36.7 
 
 
697 aa  165  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  32.94 
 
 
607 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  33.91 
 
 
570 aa  162  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  33.88 
 
 
760 aa  161  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  30.91 
 
 
574 aa  160  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  31.4 
 
 
723 aa  159  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.84 
 
 
573 aa  158  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  30.33 
 
 
585 aa  158  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  28.62 
 
 
817 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  31.51 
 
 
693 aa  157  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  33.25 
 
 
776 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  36.71 
 
 
614 aa  153  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  31.03 
 
 
692 aa  153  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.45 
 
 
1045 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0659  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.52 
 
 
450 aa  152  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808889  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  33.74 
 
 
685 aa  150  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  32.32 
 
 
865 aa  150  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  31.34 
 
 
618 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  29.61 
 
 
700 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.4 
 
 
697 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  34.08 
 
 
688 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.47 
 
 
1419 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.37 
 
 
553 aa  146  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  34.64 
 
 
956 aa  145  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.85 
 
 
560 aa  145  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.75 
 
 
616 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  34.11 
 
 
453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  31.1 
 
 
562 aa  142  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  31.25 
 
 
607 aa  141  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  32.58 
 
 
1039 aa  141  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  29.63 
 
 
744 aa  140  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  32.76 
 
 
591 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
1385 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.11 
 
 
579 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  32.34 
 
 
709 aa  138  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  30.09 
 
 
866 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  28.49 
 
 
722 aa  137  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  33.91 
 
 
855 aa  137  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  31.51 
 
 
688 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  30.79 
 
 
693 aa  136  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  35.94 
 
 
828 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  35.44 
 
 
851 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  31.31 
 
 
694 aa  135  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  28.83 
 
 
676 aa  134  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  30.37 
 
 
716 aa  134  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.02 
 
 
702 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  33.44 
 
 
1432 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  30.14 
 
 
765 aa  132  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  27.22 
 
 
754 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0617  putative PAS/PAC sensor protein  31.55 
 
 
580 aa  130  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  30.84 
 
 
753 aa  131  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  33.95 
 
 
643 aa  130  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  29.76 
 
 
730 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  33.95 
 
 
594 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  30.77 
 
 
932 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0433  putative PAS/PAC sensor protein  36.22 
 
 
627 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546697  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  29.25 
 
 
713 aa  129  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  33.11 
 
 
537 aa  127  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6792  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40 
 
 
585 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 
1390 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 
1390 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 
1390 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 
1361 aa  124  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  36.74 
 
 
770 aa  123  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.66 
 
 
583 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.07 
 
 
743 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  29.36 
 
 
743 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
1711 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0750  putative PAS/PAC sensor protein  32.92 
 
 
546 aa  121  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.0245877 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  32.67 
 
 
652 aa  121  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.07 
 
 
728 aa  120  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 
1248 aa  118  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  32.98 
 
 
745 aa  117  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
1370 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0106  PAS protein phosphatase 2C-like  25.36 
 
 
670 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 
1557 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.75 
 
 
738 aa  116  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  39.91 
 
 
1017 aa  116  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.61 
 
 
523 aa  116  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  29.87 
 
 
544 aa  117  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.52 
 
 
576 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.69 
 
 
1184 aa  115  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  30.79 
 
 
512 aa  115  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4640  putative PAS/PAC sensor protein  32.89 
 
 
427 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.74459  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  26.89 
 
 
930 aa  113  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  33.6 
 
 
1225 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  35 
 
 
755 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  26.42 
 
 
672 aa  111  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  27.39 
 
 
464 aa  111  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.51 
 
 
549 aa  110  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.61 
 
 
952 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.87 
 
 
775 aa  108  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>