More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2742 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2742  protein phosphatase 2C domain-containing protein  100 
 
 
438 aa  849    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0101851  normal  0.919668 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  45.2 
 
 
456 aa  186  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2893  putative PAS/PAC sensor protein  43.58 
 
 
393 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2937  putative PAS/PAC sensor protein  43.58 
 
 
393 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2923  putative PAS/PAC sensor protein  43.58 
 
 
393 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3857  putative PAS/PAC sensor protein  44.44 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  36.2 
 
 
391 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2632  putative PAS/PAC sensor protein  48.24 
 
 
427 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  34.46 
 
 
377 aa  139  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40.16 
 
 
688 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3852  putative PAS/PAC sensor protein  44.76 
 
 
391 aa  133  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.83404  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  38.84 
 
 
488 aa  130  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  39.24 
 
 
512 aa  126  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.07 
 
 
728 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5090  protein serine/threonine phosphatase  37.45 
 
 
487 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290329  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  31.47 
 
 
706 aa  120  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0145  protein serine/threonine phosphatase  36.07 
 
 
425 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  35.95 
 
 
743 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1109  putative PAS/PAC sensor protein  37.92 
 
 
557 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  34.31 
 
 
437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  38.82 
 
 
760 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.02 
 
 
549 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  37.86 
 
 
431 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  37.86 
 
 
431 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  37.86 
 
 
431 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  29.32 
 
 
362 aa  114  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  35.17 
 
 
846 aa  113  9e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  30.43 
 
 
708 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  36.97 
 
 
658 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.45 
 
 
1051 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.09 
 
 
445 aa  110  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.68 
 
 
775 aa  109  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  38.28 
 
 
385 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.78 
 
 
465 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.33 
 
 
480 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.7 
 
 
549 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  35.07 
 
 
694 aa  107  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  32.37 
 
 
465 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2585  protein serine/threonine phosphatase  36.93 
 
 
452 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00799832 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  29.96 
 
 
459 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  36 
 
 
693 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1031  putative GAF sensor protein  36.13 
 
 
525 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  34.7 
 
 
693 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  32.85 
 
 
438 aa  104  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  33.74 
 
 
851 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4640  putative PAS/PAC sensor protein  34.24 
 
 
427 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.74459  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  36.79 
 
 
709 aa  103  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.74 
 
 
1480 aa  103  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  32.78 
 
 
633 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  32.13 
 
 
470 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  32.82 
 
 
652 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.95 
 
 
560 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.27 
 
 
523 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.27 
 
 
957 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  31.33 
 
 
566 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  35.12 
 
 
581 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 
1711 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.02 
 
 
579 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  35.54 
 
 
700 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3103  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  34.5 
 
 
619 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5805  putative GAF sensor protein  37.39 
 
 
550 aa  100  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  35.6 
 
 
800 aa  99.8  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  32.52 
 
 
716 aa  99.8  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.68 
 
 
697 aa  99.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  32.48 
 
 
455 aa  99.8  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  29.8 
 
 
445 aa  99.8  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.82 
 
 
748 aa  99.8  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  32.68 
 
 
692 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36 
 
 
995 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 
1390 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 
1390 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 
1390 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  31.8 
 
 
828 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  31.37 
 
 
391 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  32.34 
 
 
451 aa  98.6  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  33.44 
 
 
1017 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 
781 aa  98.2  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.8 
 
 
847 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  33.04 
 
 
469 aa  97.4  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  30.05 
 
 
477 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  35.71 
 
 
713 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  30.03 
 
 
1082 aa  97.1  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.64 
 
 
692 aa  96.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  31.58 
 
 
535 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  32.38 
 
 
585 aa  96.3  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  33.73 
 
 
683 aa  95.9  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  31.64 
 
 
687 aa  95.9  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.24 
 
 
563 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  29.65 
 
 
474 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0192  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
471 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.67 
 
 
447 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  29.02 
 
 
445 aa  95.9  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  29.49 
 
 
688 aa  95.5  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  30.62 
 
 
462 aa  95.5  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  29.41 
 
 
631 aa  94.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  31.05 
 
 
413 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3329  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.29 
 
 
830 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.23 
 
 
447 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  31.03 
 
 
1079 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.18 
 
 
529 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>