More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2911 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 658 aa  1280    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.61 
 
 		 655 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  35.09 
 
 		 512 aa  157  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  34.22 
 
 		 581 aa  154  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.11 
 
 		 549 aa  151  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.38 
 
 		 688 aa  147  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  33.41 
 
 		 800 aa  146  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  34 
 
 		 694 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1031  putative GAF sensor protein  32 
 
 		 525 aa  144  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  33.92 
 
 		 693 aa  144  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  36.13 
 
 		 743 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5805  putative GAF sensor protein  32.31 
 
 		 550 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3323  serine phosphatase  31.6 
 
 		 550 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3385  stage II sporulation E family protein  31.6 
 
 		 550 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.0708395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3334  stage II sporulation E family protein  31.6 
 
 		 550 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4050  serine phosphatase  32.26 
 
 		 766 aa  135  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0145  protein serine/threonine phosphatase  36.57 
 
 		 425 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  35.21 
 
 		 377 aa  130  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  37.77 
 
 		 437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  37.2 
 
 		 488 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.26 
 
 		 728 aa  125  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  30.22 
 
 		 753 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  31.17 
 
 		 391 aa  120  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  36.65 
 
 		 431 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  36.65 
 
 		 431 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  36.65 
 
 		 431 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  30.11 
 
 		 765 aa  117  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5090  protein serine/threonine phosphatase  37.22 
 
 		 487 aa  117  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290329  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  27.95 
 
 		 744 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  32.95 
 
 		 633 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.96 
 
 		 743 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2742  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.97 
 
 		 438 aa  112  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0101851  normal  0.919668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.18 
 
 		 553 aa  111  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  29.47 
 
 		 754 aa  110  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  27.75 
 
 		 591 aa  109  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  33.45 
 
 		 700 aa  109  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.99 
 
 		 573 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  36.82 
 
 		 730 aa  107  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  31.95 
 
 		 583 aa  107  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  41.15 
 
 		 456 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  29.24 
 
 		 607 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  29.25 
 
 		 574 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  31.52 
 
 		 745 aa  106  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.17 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  37.87 
 
 		 697 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  33.42 
 
 		 760 aa  105  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.23 
 
 		 579 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2585  protein serine/threonine phosphatase  31.18 
 
 		 452 aa  104  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799832 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  34.47 
 
 		 697 aa  105  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  30.95 
 
 		 607 aa  104  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1109  putative PAS/PAC sensor protein  38.32 
 
 		 557 aa  103  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  30.5 
 
 		 776 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3857  putative PAS/PAC sensor protein  37.76 
 
 		 388 aa  103  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  35.62 
 
 		 562 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  29.59 
 
 		 713 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2893  putative PAS/PAC sensor protein  35.32 
 
 		 393 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2937  putative PAS/PAC sensor protein  35.32 
 
 		 393 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2923  putative PAS/PAC sensor protein  35.32 
 
 		 393 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  33.87 
 
 		 688 aa  102  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.83 
 
 		 1051 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  27.27 
 
 		 566 aa  102  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4481  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.65 
 
 		 549 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00461161  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  29.16 
 
 		 866 aa  100  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  29.32 
 
 		 932 aa  100  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.63 
 
 		 385 aa  100  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  29.22 
 
 		 817 aa  99.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  32.03 
 
 		 781 aa  99.8  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  34.14 
 
 		 455 aa  99.4  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.19 
 
 		 560 aa  98.6  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.67 
 
 		 792 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  28.67 
 
 		 585 aa  98.6  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.54 
 
 		 616 aa  98.2  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  30.97 
 
 		 716 aa  97.4  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  30.84 
 
 		 572 aa  97.4  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  35.34 
 
 		 693 aa  96.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.43 
 
 		 507 aa  96.3  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11810  PAS domain S-box  34.86 
 
 		 502 aa  97.1  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.32 
 
 		 572 aa  96.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  30.2 
 
 		 687 aa  96.3  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 709 aa  96.3  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 1711 aa  95.5  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  32.63 
 
 		 692 aa  95.1  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  25.89 
 
 		 612 aa  95.1  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  34.01 
 
 		 547 aa  95.1  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  33.11 
 
 		 685 aa  94.7  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  26.55 
 
 		 459 aa  94.7  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2632  putative PAS/PAC sensor protein  36.29 
 
 		 427 aa  94.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  30.62 
 
 		 631 aa  94.4  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.27 
 
 		 516 aa  94.4  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  29.77 
 
 		 865 aa  93.6  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.69 
 
 		 692 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  29.58 
 
 		 956 aa  93.2  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  30.74 
 
 		 688 aa  92.8  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  31.72 
 
 		 930 aa  92.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  29.27 
 
 		 1039 aa  92  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 		 1248 aa  92.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.5 
 
 		 775 aa  92  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  33.55 
 
 		 723 aa  91.7  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  30.49 
 
 		 706 aa  91.3  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2798  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.44 
 
 		 538 aa  90.9  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>