More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5247 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  100 
 
 
431 aa  843    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  100 
 
 
431 aa  843    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  99.54 
 
 
431 aa  837    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  46.05 
 
 
437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  46.72 
 
 
377 aa  187  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1031  putative GAF sensor protein  37.26 
 
 
525 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  37.69 
 
 
581 aa  179  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  39.6 
 
 
694 aa  176  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3323  serine phosphatase  35.31 
 
 
550 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3385  stage II sporulation E family protein  35.31 
 
 
550 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.0708395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3334  stage II sporulation E family protein  35.31 
 
 
550 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.25 
 
 
549 aa  172  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5805  putative GAF sensor protein  36.02 
 
 
550 aa  171  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  39.46 
 
 
693 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5090  protein serine/threonine phosphatase  42.45 
 
 
487 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290329  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.9 
 
 
655 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0145  protein serine/threonine phosphatase  34.09 
 
 
425 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.05 
 
 
728 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  38.93 
 
 
512 aa  157  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  37.87 
 
 
391 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  38.91 
 
 
488 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  32.27 
 
 
800 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4481  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  40.53 
 
 
549 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00461161  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  33.49 
 
 
633 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.29 
 
 
688 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  33.22 
 
 
743 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.61 
 
 
579 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2585  protein serine/threonine phosphatase  34.04 
 
 
452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00799832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  34.81 
 
 
688 aa  140  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  34.79 
 
 
760 aa  140  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.23 
 
 
560 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  41.38 
 
 
445 aa  136  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  33.03 
 
 
547 aa  133  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  35.83 
 
 
865 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  37.5 
 
 
658 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2893  putative PAS/PAC sensor protein  39.04 
 
 
393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2937  putative PAS/PAC sensor protein  39.04 
 
 
393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  30.71 
 
 
607 aa  130  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  31.84 
 
 
607 aa  129  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  36.1 
 
 
685 aa  129  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2923  putative PAS/PAC sensor protein  39.04 
 
 
393 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  39.37 
 
 
456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.73 
 
 
1045 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4050  serine phosphatase  32.35 
 
 
766 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  32.57 
 
 
866 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.09 
 
 
961 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3857  putative PAS/PAC sensor protein  40.08 
 
 
388 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  32.6 
 
 
692 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  30.63 
 
 
1039 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  35.55 
 
 
693 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.47 
 
 
1051 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  28.16 
 
 
817 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  35.46 
 
 
649 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  33.03 
 
 
745 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  31.03 
 
 
697 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.55 
 
 
1332 aa  117  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  31.92 
 
 
730 aa  117  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0966  protein serine/threonine phosphatase  36.8 
 
 
518 aa  116  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  35.12 
 
 
562 aa  116  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  32.19 
 
 
753 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2742  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.86 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0101851  normal  0.919668 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.63 
 
 
572 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.27 
 
 
553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.41 
 
 
957 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3103  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.32 
 
 
619 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  33.01 
 
 
932 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.76 
 
 
573 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1109  putative PAS/PAC sensor protein  38.74 
 
 
557 aa  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  31.33 
 
 
688 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30 
 
 
1480 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  31.76 
 
 
765 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  34 
 
 
572 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2632  putative PAS/PAC sensor protein  41.59 
 
 
427 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  30.92 
 
 
366 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  31.43 
 
 
700 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  26.26 
 
 
566 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  32.17 
 
 
1087 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  32.62 
 
 
956 aa  106  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  32.25 
 
 
744 aa  106  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.23 
 
 
583 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.82 
 
 
1004 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  32.32 
 
 
637 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  34.09 
 
 
644 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.21 
 
 
697 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.62 
 
 
549 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  31.78 
 
 
1087 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  32.37 
 
 
381 aa  103  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8733  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  37.67 
 
 
532 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  35.14 
 
 
1432 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03914  IcfG protein  35.63 
 
 
643 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  29.48 
 
 
776 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  33.8 
 
 
652 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.63 
 
 
525 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  32.87 
 
 
614 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.57 
 
 
738 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.09 
 
 
523 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.81 
 
 
748 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0848  protein serine/threonine phosphatase  35.44 
 
 
369 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509752  normal  0.225073 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  30.58 
 
 
445 aa  100  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  30.95 
 
 
1100 aa  100  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>