More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2585 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2585  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 452 aa  882    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5090  protein serine/threonine phosphatase  40.68 
 
 		 487 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290329  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3323  serine phosphatase  40 
 
 		 550 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3385  stage II sporulation E family protein  40 
 
 		 550 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.0708395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3334  stage II sporulation E family protein  40 
 
 		 550 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.22 
 
 		 549 aa  186  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0966  protein serine/threonine phosphatase  38.32 
 
 		 518 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1031  putative GAF sensor protein  39.87 
 
 		 525 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5805  putative GAF sensor protein  39.12 
 
 		 550 aa  172  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4481  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  41.23 
 
 		 549 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00461161  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  32.39 
 
 		 437 aa  154  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  37.13 
 
 		 377 aa  153  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0145  protein serine/threonine phosphatase  35.69 
 
 		 425 aa  146  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.42 
 
 		 728 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  36.18 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  36.18 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  36.18 
 
 		 431 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  34.3 
 
 		 743 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  30.37 
 
 		 800 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  33.21 
 
 		 633 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  33.96 
 
 		 488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.56 
 
 		 688 aa  130  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  31.96 
 
 		 581 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32 
 
 		 655 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2742  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.93 
 
 		 438 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0101851  normal  0.919668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3103  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.74 
 
 		 619 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  31.18 
 
 		 658 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  30.08 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  30.91 
 
 		 512 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  36.21 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  30.55 
 
 		 694 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3857  putative PAS/PAC sensor protein  35.83 
 
 		 388 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  30.85 
 
 		 693 aa  103  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2893  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2937  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2923  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  29.51 
 
 		 866 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.14 
 
 		 445 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1109  putative PAS/PAC sensor protein  33.45 
 
 		 557 aa  100  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  26.4 
 
 		 459 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.17 
 
 		 560 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  31.25 
 
 		 649 aa  97.1  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.6 
 
 		 525 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  29.29 
 
 		 648 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.01 
 
 		 952 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.19 
 
 		 529 aa  95.5  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.11 
 
 		 1332 aa  95.1  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2632  putative PAS/PAC sensor protein  34.22 
 
 		 427 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3439  serine phosphatase  29.67 
 
 		 584 aa  94  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  30 
 
 		 453 aa  94  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  28.57 
 
 		 366 aa  93.6  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  30.28 
 
 		 574 aa  93.6  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.04 
 
 		 961 aa  93.2  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1335  serine phosphatase  31.78 
 
 		 710 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.51 
 
 		 572 aa  92.8  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  29.44 
 
 		 713 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.23 
 
 		 486 aa  92  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0491  cyclic nucleotide-binding protein  33.05 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0215963  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  33.78 
 
 		 451 aa  91.3  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  28.62 
 
 		 644 aa  91.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 1711 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  28.12 
 
 		 643 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  28.12 
 
 		 594 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  32 
 
 		 776 aa  90.9  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  32.79 
 
 		 683 aa  90.1  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.72 
 
 		 1051 aa  90.1  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  30.74 
 
 		 817 aa  89.7  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.81 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.17 
 
 		 563 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.12 
 
 		 602 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  31.98 
 
 		 760 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  31.13 
 
 		 693 aa  88.2  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  30.77 
 
 		 688 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  26.42 
 
 		 708 aa  87.8  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  33.49 
 
 		 365 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  27.25 
 
 		 709 aa  87.4  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  27.99 
 
 		 716 aa  87.4  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8733  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.13 
 
 		 532 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  32.56 
 
 		 361 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  25.5 
 
 		 744 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.22 
 
 		 775 aa  85.9  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  30.07 
 
 		 566 aa  85.5  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0169  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.43 
 
 		 711 aa  84.7  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00160079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0056  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.41 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0583  response regulator receiver protein  23.79 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  30.11 
 
 		 649 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.17 
 
 		 516 aa  84.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.98 
 
 		 957 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  31.12 
 
 		 583 aa  84  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  31.5 
 
 		 956 aa  83.6  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  25.47 
 
 		 477 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  29.63 
 
 		 612 aa  83.6  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.85 
 
 		 1004 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.82 
 
 		 1017 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  30.61 
 
 		 770 aa  83.2  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  29.89 
 
 		 562 aa  83.2  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  26.35 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  27.14 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  32.11 
 
 		 1017 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  29.74 
 
 		 642 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>