More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3323 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3323  serine phosphatase  100 
 
 		 550 aa  1087    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3385  stage II sporulation E family protein  100 
 
 		 550 aa  1087    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.0708395 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5805  putative GAF sensor protein  72.64 
 
 		 550 aa  751    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3334  stage II sporulation E family protein  100 
 
 		 550 aa  1087    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1031  putative GAF sensor protein  67.03 
 
 		 525 aa  684    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  54.53 
 
 		 549 aa  515  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4481  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  49.77 
 
 		 549 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00461161  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2585  protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 		 452 aa  177  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5090  protein serine/threonine phosphatase  37.25 
 
 		 487 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290329  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  35.31 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  35.31 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  33.02 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  40.24 
 
 		 431 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0966  protein serine/threonine phosphatase  31.79 
 
 		 518 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0145  protein serine/threonine phosphatase  37.46 
 
 		 425 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  39.27 
 
 		 377 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  33.1 
 
 		 800 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.88 
 
 		 553 aa  139  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  31.6 
 
 		 658 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  35.67 
 
 		 512 aa  137  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  31.05 
 
 		 693 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.59 
 
 		 728 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  30.34 
 
 		 562 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  37.79 
 
 		 488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  30.75 
 
 		 694 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4050  serine phosphatase  28.83 
 
 		 766 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  31.18 
 
 		 581 aa  128  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.18 
 
 		 655 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  36.48 
 
 		 391 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  32.85 
 
 		 743 aa  123  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  31.24 
 
 		 574 aa  120  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2893  putative PAS/PAC sensor protein  36.95 
 
 		 393 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2937  putative PAS/PAC sensor protein  36.95 
 
 		 393 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2923  putative PAS/PAC sensor protein  36.95 
 
 		 393 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.74 
 
 		 688 aa  114  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  33.98 
 
 		 633 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  38.61 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  33.44 
 
 		 723 aa  109  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  32.13 
 
 		 547 aa  104  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.09 
 
 		 1051 aa  104  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  32.08 
 
 		 866 aa  103  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  31.38 
 
 		 566 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.33 
 
 		 572 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  31.89 
 
 		 607 aa  101  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  33.91 
 
 		 583 aa  100  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3857  putative PAS/PAC sensor protein  37.1 
 
 		 388 aa  100  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  29.87 
 
 		 366 aa  99.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  32.51 
 
 		 591 aa  99  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.46 
 
 		 579 aa  97.8  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  34.39 
 
 		 685 aa  97.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  30.42 
 
 		 745 aa  96.3  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1109  putative PAS/PAC sensor protein  36.19 
 
 		 557 aa  96.3  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  32.33 
 
 		 453 aa  96.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.12 
 
 		 1004 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3103  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.9 
 
 		 619 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  33.2 
 
 		 573 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  35.89 
 
 		 649 aa  94.7  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  34.5 
 
 		 585 aa  94  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.71 
 
 		 961 aa  93.6  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  32.84 
 
 		 618 aa  92.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  29.46 
 
 		 692 aa  92.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.39 
 
 		 957 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  31.07 
 
 		 865 aa  92  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  31.85 
 
 		 572 aa  91.3  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.46 
 
 		 576 aa  90.9  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  25.87 
 
 		 688 aa  90.5  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2742  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.87 
 
 		 438 aa  90.5  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0101851  normal  0.919668 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  29.32 
 
 		 708 aa  89.7  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.75 
 
 		 1332 aa  89  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  32.73 
 
 		 760 aa  87.8  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.81 
 
 		 525 aa  87.8  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  33.81 
 
 		 1100 aa  87.4  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.74 
 
 		 549 aa  87.4  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  27.52 
 
 		 465 aa  87  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  30.2 
 
 		 594 aa  87.4  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  30.2 
 
 		 643 aa  87  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  31.78 
 
 		 771 aa  86.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  33.07 
 
 		 713 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.92 
 
 		 486 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  29.46 
 
 		 1087 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.52 
 
 		 465 aa  86.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2632  putative PAS/PAC sensor protein  33.77 
 
 		 427 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  29.83 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  34.27 
 
 		 543 aa  85.9  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  32.22 
 
 		 693 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  30.55 
 
 		 469 aa  85.9  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  27.86 
 
 		 1039 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.38 
 
 		 775 aa  85.9  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  32.51 
 
 		 544 aa  84.7  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  32.39 
 
 		 630 aa  85.1  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  31.45 
 
 		 716 aa  85.1  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  32.21 
 
 		 649 aa  84.7  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  29.83 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  31.42 
 
 		 614 aa  84  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.03 
 
 		 952 aa  84  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  31.87 
 
 		 730 aa  84  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.83 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  29.58 
 
 		 930 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  29.55 
 
 		 932 aa  83.2  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4122  Stage II sporulation E family protein  34.48 
 
 		 805 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.530219  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>