More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2923 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2893  putative PAS/PAC sensor protein  99.49 
 
 
393 aa  776    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2937  putative PAS/PAC sensor protein  99.49 
 
 
393 aa  776    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2923  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
393 aa  779    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3857  putative PAS/PAC sensor protein  59.74 
 
 
388 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2632  putative PAS/PAC sensor protein  49.25 
 
 
427 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  45.17 
 
 
456 aa  302  6.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3852  putative PAS/PAC sensor protein  44.24 
 
 
391 aa  272  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.83404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  42.41 
 
 
391 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2742  protein phosphatase 2C domain-containing protein  43.58 
 
 
438 aa  173  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0101851  normal  0.919668 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  37.3 
 
 
512 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  35.97 
 
 
377 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.58 
 
 
445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  39.04 
 
 
431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  39.04 
 
 
431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  39.04 
 
 
431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0145  protein serine/threonine phosphatase  36.05 
 
 
425 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  37.79 
 
 
581 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  37.7 
 
 
633 aa  124  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.89 
 
 
549 aa  119  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1031  putative GAF sensor protein  36.14 
 
 
525 aa  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5805  putative GAF sensor protein  36.95 
 
 
550 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3323  serine phosphatase  36.95 
 
 
550 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3385  stage II sporulation E family protein  36.95 
 
 
550 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.0708395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3334  stage II sporulation E family protein  36.95 
 
 
550 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4364  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.76 
 
 
572 aa  116  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2853  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.13 
 
 
584 aa  116  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5090  protein serine/threonine phosphatase  37.7 
 
 
487 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290329  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  35.77 
 
 
488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  35.91 
 
 
437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0619  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.65 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0923552  normal  0.109315 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.59 
 
 
792 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  35.71 
 
 
743 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3103  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  36.22 
 
 
619 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  42.24 
 
 
757 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.18 
 
 
486 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.51 
 
 
688 aa  107  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.84 
 
 
385 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  35.71 
 
 
846 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  37.27 
 
 
693 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  31.87 
 
 
708 aa  104  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.14 
 
 
728 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  35.61 
 
 
697 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.69 
 
 
748 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  33.85 
 
 
649 aa  103  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  27.93 
 
 
409 aa  102  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  35.32 
 
 
658 aa  103  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4077  putative PAS/PAC sensor protein  41.67 
 
 
135 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.13 
 
 
995 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  33.67 
 
 
683 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  31.06 
 
 
644 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.82 
 
 
655 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  36.8 
 
 
544 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  32.11 
 
 
706 aa  100  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  31.7 
 
 
612 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  34.9 
 
 
692 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  34.44 
 
 
260 aa  99.8  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  34.53 
 
 
693 aa  99.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  34.01 
 
 
692 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  30.77 
 
 
455 aa  98.6  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.69 
 
 
579 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.82 
 
 
1017 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  31.87 
 
 
459 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  36.43 
 
 
697 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.51 
 
 
572 aa  97.8  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  38.19 
 
 
1432 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  28.33 
 
 
631 aa  97.1  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.33 
 
 
602 aa  97.1  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3774  PAS  41.09 
 
 
395 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.195933  normal  0.315596 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  34.48 
 
 
687 aa  96.3  8e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  29.77 
 
 
1017 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  30.43 
 
 
470 aa  95.1  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  36.99 
 
 
713 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  32.6 
 
 
563 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  33.73 
 
 
574 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1109  putative PAS/PAC sensor protein  36.6 
 
 
557 aa  94.4  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  34.18 
 
 
694 aa  94.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  28.44 
 
 
649 aa  94.4  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  30.36 
 
 
443 aa  94  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1605  sensory box histidine kinase  39.84 
 
 
391 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.747269  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  35.79 
 
 
700 aa  94  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  30.47 
 
 
688 aa  93.6  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0966  protein serine/threonine phosphatase  33.11 
 
 
518 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2585  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
452 aa  93.6  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00799832 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  27.52 
 
 
716 aa  93.2  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  35.27 
 
 
738 aa  92.8  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  28.35 
 
 
438 aa  92.8  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3183  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
442 aa  92.8  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319198  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  29.54 
 
 
469 aa  92.8  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  35.62 
 
 
851 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.39 
 
 
1051 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  34.48 
 
 
705 aa  91.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.94 
 
 
566 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.5 
 
 
1004 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  30.43 
 
 
781 aa  90.9  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.27 
 
 
465 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2467  putative PAS/PAC sensor protein  27.5 
 
 
481 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6441  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
375 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.152019 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  34.34 
 
 
1225 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  29.07 
 
 
451 aa  90.1  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.21 
 
 
563 aa  90.1  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>