More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6441 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6441  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 375 aa  751    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.152019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0619  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.17 
 
 		 379 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0923552  normal  0.109315 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2321  GAF sensor signal transduction histidine kinase  52.32 
 
 		 396 aa  226  6e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.988363 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  47.28 
 
 		 396 aa  216  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3774  PAS  34.92 
 
 		 395 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.195933  normal  0.315596 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3773  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  47.5 
 
 		 394 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719874  normal  0.310272 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5176  GAF sensor signal transduction histidine kinase  51.05 
 
 		 570 aa  205  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1605  sensory box histidine kinase  34.48 
 
 		 391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.747269  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1606  sensor histidine kinase  45.83 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.61 
 
 		 405 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364137  hitchhiker  0.00137418 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3583  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 397 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2993  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3183  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03779  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  41.28 
 
 		 410 aa  171  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.601764  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2762  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 		 373 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3149  histidine kinase  35.27 
 
 		 383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.458506  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2123  sensor histidine kinase  37.55 
 
 		 306 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424772  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0650  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 382 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1918  sensor histidine kinase  34.22 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166178 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4368  histidine kinase  38.46 
 
 		 373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6991  histidine kinase  36.07 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2988  histidine kinase  36.07 
 
 		 380 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.539821  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0256  histidine kinase  36.24 
 
 		 405 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4439  sensor histidine kinase  30.56 
 
 		 376 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1997  histidine kinase  36.94 
 
 		 371 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.337155  normal  0.0103218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3968  sensor histidine kinase  39.62 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838601  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5936  histidine kinase  38.02 
 
 		 373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287383  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 734 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.656612  hitchhiker  0.0000890263 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0278  histidine kinase  35.37 
 
 		 405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 595 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6438  histidine kinase  36.25 
 
 		 373 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0629  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 382 aa  129  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.67365  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2123  histidine kinase  36.49 
 
 		 373 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0267  histidine kinase  35.37 
 
 		 405 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 618 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 621 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1538  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 394 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461461  normal  0.397408 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0278  histidine kinase  35.1 
 
 		 471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.182643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4896  sensor histidine kinase  32.88 
 
 		 376 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3993  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.967169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3122  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.17 
 
 		 540 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.340394  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3518  histidine kinase  34.76 
 
 		 364 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2279  histidine kinase  35.83 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10700  putative bacteriophytochrome  36.32 
 
 		 728 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0030  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0975  putative bacteriophytochrome  36.04 
 
 		 728 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3228  histidine kinase  38.07 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3912  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 912 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237166  normal  0.236216 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  41.8 
 
 		 757 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 557 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5387  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 375 aa  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0971839 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0290  histidine kinase  31.82 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.81 
 
 		 929 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  44.96 
 
 		 456 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4077  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 		 135 aa  109  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1000  histidine kinase  31.58 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.146298  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2980  histidine kinase  38.38 
 
 		 209 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0761961  normal  0.0124572 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 461 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00764508  normal  0.232997 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 375 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.745377  normal  0.599724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  31.2 
 
 		 586 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3852  putative PAS/PAC sensor protein  41.35 
 
 		 391 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.83404  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.02 
 
 		 989 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 564 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139979  normal  0.523633 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0832  histidine kinase  32.27 
 
 		 383 aa  105  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.636786  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 604 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1870  histidine kinase  32.05 
 
 		 462 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302467 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 490 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0053  two component sensor histidine kinase  28.76 
 
 		 867 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0579  histidine kinase  28.09 
 
 		 375 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 535 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03623  sensor histidine kinase  28.03 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  30 
 
 		 535 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4726  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 368 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 958 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 535 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.24 
 
 		 1391 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.87 
 
 		 989 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 535 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2632  putative PAS/PAC sensor protein  37.59 
 
 		 427 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 		 776 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1010 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 456 aa  101  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.17 
 
 		 1043 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 518 aa  100  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2878  PAS sensor protein  24.9 
 
 		 372 aa  99.8  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2525  sensor histidine kinase  28.39 
 
 		 385 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 381 aa  99.4  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2563  sensor histidine kinase  27.97 
 
 		 385 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0187455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2616  sensor histidine kinase  27.97 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2797  sensor histidine kinase  28.39 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164259 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2301  sensor histidine kinase  27.97 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 590 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 384 aa  99.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.863381  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 776 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2560  sensor histidine kinase  27.97 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1740  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129887 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2573  sensor histidine kinase  27.97 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000106613 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.55 
 
 		 919 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1440  histidine kinase  31.36 
 
 		 427 aa  98.2  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>