More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4921 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  100 
 
 		 549 aa  1083    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5805  putative GAF sensor protein  57.09 
 
 		 550 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3323  serine phosphatase  54.53 
 
 		 550 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3385  stage II sporulation E family protein  54.53 
 
 		 550 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.0708395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3334  stage II sporulation E family protein  54.53 
 
 		 550 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1031  putative GAF sensor protein  54.36 
 
 		 525 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4481  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  49.08 
 
 		 549 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00461161  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5090  protein serine/threonine phosphatase  42.04 
 
 		 487 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2585  protein serine/threonine phosphatase  39.74 
 
 		 452 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799832 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  33.18 
 
 		 437 aa  172  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  35.25 
 
 		 431 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  35.25 
 
 		 431 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  35.01 
 
 		 431 aa  170  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  38.91 
 
 		 694 aa  170  8e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  38.23 
 
 		 693 aa  167  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  37.16 
 
 		 512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.15 
 
 		 655 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  34.11 
 
 		 658 aa  164  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  39.15 
 
 		 800 aa  157  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0966  protein serine/threonine phosphatase  35.52 
 
 		 518 aa  156  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.23 
 
 		 728 aa  154  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0145  protein serine/threonine phosphatase  36.36 
 
 		 425 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  36.09 
 
 		 581 aa  150  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  38.62 
 
 		 377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  36.78 
 
 		 488 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  36.78 
 
 		 391 aa  143  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  31.69 
 
 		 574 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  30.5 
 
 		 743 aa  141  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4050  serine phosphatase  32.3 
 
 		 766 aa  140  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.23 
 
 		 688 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.62 
 
 		 553 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  31.42 
 
 		 583 aa  137  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  35.06 
 
 		 633 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  31.4 
 
 		 562 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.62 
 
 		 572 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  40.08 
 
 		 456 aa  130  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  34.11 
 
 		 723 aa  130  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.26 
 
 		 1051 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.02 
 
 		 445 aa  126  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  32.78 
 
 		 547 aa  126  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  31.77 
 
 		 607 aa  123  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  32 
 
 		 618 aa  121  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  30.13 
 
 		 866 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.93 
 
 		 576 aa  120  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2893  putative PAS/PAC sensor protein  35.89 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  34.17 
 
 		 685 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2937  putative PAS/PAC sensor protein  35.89 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2923  putative PAS/PAC sensor protein  35.89 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  35.87 
 
 		 607 aa  117  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  31.38 
 
 		 930 aa  116  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  31.71 
 
 		 688 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2742  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.02 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0101851  normal  0.919668 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  28.71 
 
 		 817 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.05 
 
 		 467 aa  113  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  33.88 
 
 		 572 aa  113  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  31.94 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  34.81 
 
 		 730 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  29.93 
 
 		 721 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  31.25 
 
 		 932 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  33.77 
 
 		 760 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  35 
 
 		 637 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  31.7 
 
 		 865 aa  111  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1109  putative PAS/PAC sensor protein  37.84 
 
 		 557 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 		 614 aa  110  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  29.41 
 
 		 585 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  31.52 
 
 		 470 aa  110  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  32.57 
 
 		 697 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.82 
 
 		 775 aa  109  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2019  protein serine/threonine phosphatase  34.01 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  33.06 
 
 		 573 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  34.27 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  33.22 
 
 		 1039 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  32.01 
 
 		 688 aa  108  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  32.32 
 
 		 469 aa  108  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  32.28 
 
 		 709 aa  108  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  34.22 
 
 		 687 aa  107  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0442  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.69 
 
 		 421 aa  107  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723738  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  29.8 
 
 		 544 aa  107  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  30.03 
 
 		 753 aa  106  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  31.4 
 
 		 465 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  31.56 
 
 		 692 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  37.07 
 
 		 649 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  32.13 
 
 		 445 aa  106  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.6 
 
 		 516 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  27.74 
 
 		 566 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.4 
 
 		 465 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3103  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.41 
 
 		 619 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  32.13 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.44 
 
 		 1248 aa  104  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 956 aa  103  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  33 
 
 		 700 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.73 
 
 		 388 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0617  putative PAS/PAC sensor protein  33.1 
 
 		 580 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  33.21 
 
 		 713 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30 
 
 		 579 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  33.64 
 
 		 1087 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  39.18 
 
 		 652 aa  101  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0376  putative PAS/PAC sensor protein  32.33 
 
 		 408 aa  101  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000066026  normal  0.449331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  33.59 
 
 		 692 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3857  putative PAS/PAC sensor protein  33.6 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.116252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>