More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5201 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  64.26 
 
 		 743 aa  922    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  100 
 
 		 728 aa  1457    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  41.05 
 
 		 688 aa  411  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  48.76 
 
 		 512 aa  337  5.999999999999999e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0145  protein serine/threonine phosphatase  41.06 
 
 		 425 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.99 
 
 		 655 aa  251  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  32.11 
 
 		 694 aa  246  8e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  35.62 
 
 		 800 aa  220  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  35.29 
 
 		 693 aa  205  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  33.55 
 
 		 581 aa  196  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4050  serine phosphatase  33.33 
 
 		 766 aa  193  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  38.17 
 
 		 377 aa  165  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  38.02 
 
 		 488 aa  159  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  32.48 
 
 		 760 aa  150  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.23 
 
 		 549 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  31.05 
 
 		 431 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  31.05 
 
 		 431 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  31.05 
 
 		 431 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  36.25 
 
 		 391 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  33.69 
 
 		 713 aa  144  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  32.31 
 
 		 618 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  31.28 
 
 		 866 aa  143  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  31.58 
 
 		 633 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  28.78 
 
 		 437 aa  139  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  32.13 
 
 		 956 aa  136  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3323  serine phosphatase  29.59 
 
 		 550 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3385  stage II sporulation E family protein  29.59 
 
 		 550 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.0708395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3334  stage II sporulation E family protein  29.59 
 
 		 550 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2585  protein serine/threonine phosphatase  34.42 
 
 		 452 aa  135  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799832 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  35.41 
 
 		 685 aa  134  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1031  putative GAF sensor protein  32.45 
 
 		 525 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  30.23 
 
 		 547 aa  132  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5090  protein serine/threonine phosphatase  35.63 
 
 		 487 aa  130  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290329  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.4 
 
 		 445 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5805  putative GAF sensor protein  31.97 
 
 		 550 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.98 
 
 		 750 aa  128  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  36.63 
 
 		 456 aa  127  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  31.72 
 
 		 607 aa  127  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  29.88 
 
 		 562 aa  127  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  32.88 
 
 		 757 aa  127  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.8 
 
 		 563 aa  127  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  28.38 
 
 		 574 aa  126  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.92 
 
 		 1017 aa  127  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  29.22 
 
 		 583 aa  125  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  36.26 
 
 		 658 aa  125  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4481  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.4 
 
 		 549 aa  125  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00461161  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.23 
 
 		 553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1109  putative PAS/PAC sensor protein  37.15 
 
 		 557 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2742  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.07 
 
 		 438 aa  120  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0101851  normal  0.919668 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  32.66 
 
 		 453 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  30.93 
 
 		 570 aa  118  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  28.23 
 
 		 932 aa  119  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  30.82 
 
 		 865 aa  119  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  30.6 
 
 		 607 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  32.58 
 
 		 721 aa  117  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.07 
 
 		 957 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  29.63 
 
 		 723 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.97 
 
 		 467 aa  115  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  32.55 
 
 		 688 aa  114  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  26.71 
 
 		 585 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.64 
 
 		 1004 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  30.15 
 
 		 470 aa  110  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.21 
 
 		 465 aa  110  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  30.59 
 
 		 765 aa  109  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.13 
 
 		 961 aa  109  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  28.02 
 
 		 572 aa  108  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 1711 aa  108  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.72 
 
 		 616 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  30.6 
 
 		 817 aa  108  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  29.67 
 
 		 730 aa  108  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0433  putative PAS/PAC sensor protein  32.3 
 
 		 627 aa  108  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546697  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  29.91 
 
 		 465 aa  107  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  28.71 
 
 		 612 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  29.55 
 
 		 776 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  29.38 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  32.38 
 
 		 723 aa  106  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  32.89 
 
 		 652 aa  105  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.36 
 
 		 573 aa  104  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3439  serine phosphatase  25 
 
 		 584 aa  104  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2893  putative PAS/PAC sensor protein  33.73 
 
 		 393 aa  104  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2937  putative PAS/PAC sensor protein  33.73 
 
 		 393 aa  104  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2923  putative PAS/PAC sensor protein  33.73 
 
 		 393 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.63 
 
 		 1332 aa  103  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  31.15 
 
 		 753 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11810  PAS domain S-box  33.9 
 
 		 502 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.16 
 
 		 1051 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  28.3 
 
 		 716 aa  102  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  32.6 
 
 		 614 aa  102  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  29.28 
 
 		 781 aa  102  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.91 
 
 		 1480 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0966  protein serine/threonine phosphatase  30.45 
 
 		 518 aa  99.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  29.3 
 
 		 438 aa  100  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  27.54 
 
 		 591 aa  98.6  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  31.21 
 
 		 745 aa  98.2  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6792  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.57 
 
 		 585 aa  97.8  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2632  putative PAS/PAC sensor protein  35.58 
 
 		 427 aa  97.8  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.68 
 
 		 423 aa  97.4  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.03 
 
 		 560 aa  97.4  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.27 
 
 		 583 aa  97.4  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.7 
 
 		 579 aa  97.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>