More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4481 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4481  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  100 
 
 		 549 aa  1065    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00461161  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3323  serine phosphatase  45.09 
 
 		 550 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3385  stage II sporulation E family protein  45.09 
 
 		 550 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.0708395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3334  stage II sporulation E family protein  45.09 
 
 		 550 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  45.91 
 
 		 549 aa  355  7.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1031  putative GAF sensor protein  45.28 
 
 		 525 aa  350  3e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5805  putative GAF sensor protein  45.56 
 
 		 550 aa  342  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5090  protein serine/threonine phosphatase  36.99 
 
 		 487 aa  199  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2585  protein serine/threonine phosphatase  41.23 
 
 		 452 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0966  protein serine/threonine phosphatase  34.8 
 
 		 518 aa  176  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  40.88 
 
 		 431 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  40.88 
 
 		 431 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  40.53 
 
 		 431 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  38.24 
 
 		 488 aa  159  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  31.12 
 
 		 437 aa  156  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  37.07 
 
 		 800 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  37.11 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.87 
 
 		 728 aa  148  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  35.77 
 
 		 633 aa  145  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0145  protein serine/threonine phosphatase  31.41 
 
 		 425 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  32.1 
 
 		 512 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.78 
 
 		 688 aa  134  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  39.39 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  30.5 
 
 		 581 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  29.54 
 
 		 658 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  29.71 
 
 		 743 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  34.45 
 
 		 693 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.99 
 
 		 655 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  31.88 
 
 		 694 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  40.33 
 
 		 456 aa  124  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4050  serine phosphatase  30.15 
 
 		 766 aa  115  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.04 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.54 
 
 		 952 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2893  putative PAS/PAC sensor protein  34.13 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2937  putative PAS/PAC sensor protein  34.13 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2923  putative PAS/PAC sensor protein  34.13 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.84 
 
 		 560 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  31.91 
 
 		 562 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.24 
 
 		 1004 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  29.01 
 
 		 607 aa  104  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  32.8 
 
 		 692 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  30 
 
 		 591 aa  102  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.79 
 
 		 572 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.05 
 
 		 1051 aa  100  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.01 
 
 		 563 aa  100  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  28.99 
 
 		 574 aa  98.6  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.29 
 
 		 1017 aa  98.2  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3103  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.13 
 
 		 619 aa  97.4  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  30.45 
 
 		 366 aa  97.1  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  32.14 
 
 		 700 aa  97.1  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  32.16 
 
 		 566 aa  97.1  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  27.89 
 
 		 817 aa  96.7  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2742  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.7 
 
 		 438 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0101851  normal  0.919668 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.69 
 
 		 516 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.68 
 
 		 553 aa  94.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  25.6 
 
 		 362 aa  95.1  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  28.04 
 
 		 462 aa  95.1  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  33.8 
 
 		 451 aa  94.7  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  28.66 
 
 		 744 aa  94.4  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  26.81 
 
 		 753 aa  94  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  31.35 
 
 		 688 aa  93.2  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  33.71 
 
 		 572 aa  93.2  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  30.56 
 
 		 688 aa  92.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.69 
 
 		 750 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.86 
 
 		 482 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  29.84 
 
 		 713 aa  92  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  33.66 
 
 		 685 aa  91.3  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  27.76 
 
 		 754 aa  90.5  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  28.89 
 
 		 697 aa  90.9  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3857  putative PAS/PAC sensor protein  34.87 
 
 		 388 aa  90.5  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.34 
 
 		 697 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  31.53 
 
 		 630 aa  89.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  34.92 
 
 		 760 aa  89.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  33.65 
 
 		 649 aa  88.2  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  31.22 
 
 		 634 aa  88.6  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  32.1 
 
 		 708 aa  88.6  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  31.69 
 
 		 693 aa  88.2  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  31.32 
 
 		 544 aa  87.8  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  30.58 
 
 		 583 aa  87.8  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.02 
 
 		 1332 aa  87.4  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.08 
 
 		 961 aa  87  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  32.39 
 
 		 618 aa  87  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  30.33 
 
 		 644 aa  87  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  30.99 
 
 		 706 aa  87  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  31.49 
 
 		 455 aa  86.7  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  30.29 
 
 		 1100 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.62 
 
 		 579 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  24.02 
 
 		 612 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.28 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  31.25 
 
 		 585 aa  85.5  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0195  sigma factor sigB regulation protein  25.08 
 
 		 683 aa  84.7  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.18 
 
 		 957 aa  84.3  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  29.55 
 
 		 465 aa  84  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  35.96 
 
 		 846 aa  84  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0583  response regulator receiver protein  23.33 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  32.37 
 
 		 1432 aa  83.6  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  27.19 
 
 		 1087 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.21 
 
 		 1045 aa  83.6  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8733  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.08 
 
 		 532 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.6 
 
 		 480 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>