More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1109 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1109  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 557 aa  1078    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  39.6 
 
 		 512 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.15 
 
 		 728 aa  135  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  36.99 
 
 		 694 aa  133  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  39 
 
 		 391 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  38.74 
 
 		 633 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3857  putative PAS/PAC sensor protein  40.24 
 
 		 388 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2742  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.81 
 
 		 438 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0101851  normal  0.919668 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  34.56 
 
 		 743 aa  127  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  36.18 
 
 		 693 aa  127  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  39.76 
 
 		 377 aa  126  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  37.62 
 
 		 581 aa  126  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  42.52 
 
 		 437 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0376  putative PAS/PAC sensor protein  43.24 
 
 		 408 aa  125  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000066026  normal  0.449331 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  39.13 
 
 		 431 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  42 
 
 		 456 aa  124  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  38.43 
 
 		 488 aa  123  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  38.74 
 
 		 431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  38.74 
 
 		 431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 1043 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39 
 
 		 549 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0076  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  29.2 
 
 		 898 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.18 
 
 		 688 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.53 
 
 		 655 aa  117  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0145  protein serine/threonine phosphatase  36.86 
 
 		 425 aa  116  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  32.57 
 
 		 700 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  28.86 
 
 		 438 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1031  putative GAF sensor protein  38.13 
 
 		 525 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5805  putative GAF sensor protein  39.3 
 
 		 550 aa  114  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5033  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.4 
 
 		 389 aa  113  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  36.44 
 
 		 697 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  31.48 
 
 		 688 aa  110  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5090  protein serine/threonine phosphatase  36 
 
 		 487 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290329  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3323  serine phosphatase  36.96 
 
 		 550 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3385  stage II sporulation E family protein  36.96 
 
 		 550 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.0708395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3334  stage II sporulation E family protein  36.96 
 
 		 550 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  34.22 
 
 		 1087 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.31 
 
 		 1550 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  30.9 
 
 		 537 aa  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  38.32 
 
 		 658 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 934 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  36.43 
 
 		 800 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  29.97 
 
 		 706 aa  107  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 1361 aa  107  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4050  serine phosphatase  32.25 
 
 		 766 aa  106  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  35.94 
 
 		 649 aa  106  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2893  putative PAS/PAC sensor protein  36.6 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 1370 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2937  putative PAS/PAC sensor protein  36.6 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.21 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2923  putative PAS/PAC sensor protein  36.6 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  38.53 
 
 		 713 aa  104  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.99 
 
 		 590 aa  104  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  28.67 
 
 		 744 aa  103  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  32.67 
 
 		 817 aa  103  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.45 
 
 		 1248 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  32.94 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.02 
 
 		 961 aa  103  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3103  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  33.1 
 
 		 619 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  34.47 
 
 		 692 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  31.51 
 
 		 574 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 1711 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  33.78 
 
 		 1087 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  26.86 
 
 		 765 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  32.89 
 
 		 760 aa  101  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  34.55 
 
 		 649 aa  101  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  34.96 
 
 		 637 aa  101  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  33.2 
 
 		 486 aa  100  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6792  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.63 
 
 		 585 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  36.61 
 
 		 563 aa  99.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  33.95 
 
 		 709 aa  99.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  26.69 
 
 		 753 aa  98.6  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  32.85 
 
 		 614 aa  99.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.9 
 
 		 750 aa  99.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  34.82 
 
 		 693 aa  98.2  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  30.8 
 
 		 413 aa  97.8  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  32.8 
 
 		 607 aa  97.8  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 		 738 aa  97.8  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  34.17 
 
 		 467 aa  97.1  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  33.58 
 
 		 455 aa  97.1  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  32.81 
 
 		 721 aa  96.7  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.89 
 
 		 467 aa  96.7  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2632  putative PAS/PAC sensor protein  35.19 
 
 		 427 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  28.26 
 
 		 865 aa  96.3  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  32.86 
 
 		 472 aa  95.9  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.21 
 
 		 957 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  33.73 
 
 		 708 aa  95.5  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.69 
 
 		 523 aa  95.1  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  33.72 
 
 		 583 aa  95.1  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.03 
 
 		 385 aa  95.1  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.08 
 
 		 702 aa  94.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  33.68 
 
 		 723 aa  94.7  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  32.16 
 
 		 469 aa  94.7  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.68 
 
 		 563 aa  94.7  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  27.21 
 
 		 754 aa  94.7  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3698  Stage II sporulation E family protein  37.05 
 
 		 570 aa  94.7  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.15 
 
 		 371 aa  94.4  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  31.85 
 
 		 594 aa  94.4  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  31.85 
 
 		 643 aa  94.4  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.74 
 
 		 606 aa  94  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>