More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5090 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5090  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 487 aa  938    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2585  protein serine/threonine phosphatase  40.68 
 
 		 452 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.71 
 
 		 549 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5805  putative GAF sensor protein  34.54 
 
 		 550 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3323  serine phosphatase  37.64 
 
 		 550 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3385  stage II sporulation E family protein  37.64 
 
 		 550 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.0708395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3334  stage II sporulation E family protein  37.64 
 
 		 550 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1031  putative GAF sensor protein  32.16 
 
 		 525 aa  170  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4481  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  40.24 
 
 		 549 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00461161  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  42.45 
 
 		 431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  42.45 
 
 		 431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  42.45 
 
 		 431 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  36.22 
 
 		 437 aa  156  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0966  protein serine/threonine phosphatase  34.6 
 
 		 518 aa  156  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  36.26 
 
 		 377 aa  149  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  36.43 
 
 		 512 aa  144  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0145  protein serine/threonine phosphatase  36.3 
 
 		 425 aa  143  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.28 
 
 		 688 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  34.22 
 
 		 488 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  35.9 
 
 		 743 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  35.2 
 
 		 694 aa  137  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.6 
 
 		 728 aa  133  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  36.76 
 
 		 800 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  36.98 
 
 		 581 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  34.21 
 
 		 693 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  40.17 
 
 		 456 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  35.66 
 
 		 391 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.84 
 
 		 655 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  37.34 
 
 		 658 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.5 
 
 		 560 aa  123  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  34.91 
 
 		 486 aa  121  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2742  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.45 
 
 		 438 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0101851  normal  0.919668 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  34.96 
 
 		 649 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  34.94 
 
 		 455 aa  117  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4050  serine phosphatase  31.97 
 
 		 766 aa  116  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  30.94 
 
 		 637 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2893  putative PAS/PAC sensor protein  37.78 
 
 		 393 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2937  putative PAS/PAC sensor protein  37.78 
 
 		 393 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2923  putative PAS/PAC sensor protein  37.78 
 
 		 393 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.62 
 
 		 572 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  33.83 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  30.77 
 
 		 648 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  32.18 
 
 		 753 aa  111  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.61 
 
 		 775 aa  110  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.06 
 
 		 1051 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1818  protein serine/threonine phosphatase  32.79 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  28.68 
 
 		 708 aa  106  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.42 
 
 		 563 aa  107  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  30.57 
 
 		 633 aa  106  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.32 
 
 		 579 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  28.09 
 
 		 706 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1109  putative PAS/PAC sensor protein  35.86 
 
 		 557 aa  105  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  32.11 
 
 		 713 aa  105  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  27.88 
 
 		 644 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3103  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.94 
 
 		 619 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  30.74 
 
 		 687 aa  105  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  30 
 
 		 381 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  24.12 
 
 		 362 aa  104  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  29 
 
 		 716 aa  103  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  36.62 
 
 		 693 aa  103  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  32.26 
 
 		 631 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  28.57 
 
 		 445 aa  102  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  29.71 
 
 		 688 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  31.13 
 
 		 1083 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5033  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.24 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0376  putative PAS/PAC sensor protein  32.58 
 
 		 408 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000066026  normal  0.449331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2632  putative PAS/PAC sensor protein  38.28 
 
 		 427 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.21 
 
 		 697 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  30.8 
 
 		 543 aa  100  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  25.84 
 
 		 705 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  29.26 
 
 		 866 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  32.37 
 
 		 846 aa  100  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  28.66 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  28.83 
 
 		 472 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  32.2 
 
 		 547 aa  99.8  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  30.62 
 
 		 1087 aa  99  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  31.66 
 
 		 685 aa  99  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  31.7 
 
 		 692 aa  99  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  30.23 
 
 		 1087 aa  99  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  33.05 
 
 		 683 aa  97.4  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  30.62 
 
 		 453 aa  97.4  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  29.69 
 
 		 1082 aa  97.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.47 
 
 		 385 aa  97.1  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  27.93 
 
 		 754 aa  96.7  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.37 
 
 		 445 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  32.54 
 
 		 594 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  32.54 
 
 		 643 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2019  protein serine/threonine phosphatase  30.14 
 
 		 308 aa  96.3  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  30.88 
 
 		 721 aa  96.3  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_002620  TC0877  regulatory protein, putative  30.3 
 
 		 650 aa  95.9  2e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.410467  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  32.56 
 
 		 697 aa  95.5  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  31.47 
 
 		 765 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.96 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  32.63 
 
 		 467 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.74 
 
 		 957 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  30.19 
 
 		 574 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  29.62 
 
 		 410 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  27.78 
 
 		 459 aa  94.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8733  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.15 
 
 		 532 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  32.56 
 
 		 709 aa  94.4  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>