More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8733 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8733  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  100 
 
 		 532 aa  1061    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6994  putative PAS/PAC sensor protein  34.24 
 
 		 797 aa  224  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5852  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  40.26 
 
 		 424 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910285  normal  0.678328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.54 
 
 		 847 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1818  protein serine/threonine phosphatase  39.18 
 
 		 309 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.1 
 
 		 560 aa  141  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3329  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.84 
 
 		 830 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  33.12 
 
 		 453 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4640  putative PAS/PAC sensor protein  36.9 
 
 		 427 aa  127  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.74459  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  36.77 
 
 		 562 aa  124  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  38.17 
 
 		 614 aa  124  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.1 
 
 		 1051 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 1039 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.2 
 
 		 775 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.18 
 
 		 738 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.53 
 
 		 553 aa  117  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  38.81 
 
 		 713 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  37.17 
 
 		 692 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2800  putative PAS/PAC sensor protein  28.41 
 
 		 783 aa  114  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0659  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.25 
 
 		 450 aa  113  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0433  putative PAS/PAC sensor protein  34.92 
 
 		 627 aa  113  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546697  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  34.03 
 
 		 817 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.52 
 
 		 572 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 		 688 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.02 
 
 		 529 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  32.81 
 
 		 618 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  36.8 
 
 		 260 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.47 
 
 		 579 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  34.58 
 
 		 637 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 1711 aa  110  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  33.73 
 
 		 865 aa  109  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  38.28 
 
 		 583 aa  109  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.56 
 
 		 750 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  35.06 
 
 		 607 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  34.65 
 
 		 770 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  41.08 
 
 		 544 aa  106  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2798  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.44 
 
 		 538 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 572 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  32.67 
 
 		 574 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  33.85 
 
 		 676 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13090  Stage II sporulation protein E (SpoIIE)  29.41 
 
 		 576 aa  105  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  34.29 
 
 		 709 aa  104  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  32.55 
 
 		 547 aa  104  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  31.23 
 
 		 649 aa  104  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  34.21 
 
 		 738 aa  104  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  30.13 
 
 		 692 aa  104  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.93 
 
 		 573 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  30.34 
 
 		 743 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11810  PAS domain S-box  34.23 
 
 		 502 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  36.63 
 
 		 697 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 1385 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  32.42 
 
 		 585 aa  103  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  32.63 
 
 		 591 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  33.21 
 
 		 1017 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  36.92 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  38.66 
 
 		 1432 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  34.4 
 
 		 866 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  36.92 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  33.33 
 
 		 828 aa  103  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  32.04 
 
 		 391 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  36.92 
 
 		 755 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  34.13 
 
 		 721 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  33.47 
 
 		 693 aa  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  35.62 
 
 		 730 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  31.53 
 
 		 716 aa  101  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.33 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  31.4 
 
 		 644 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  32.23 
 
 		 932 aa  101  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  33.71 
 
 		 570 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.98 
 
 		 523 aa  101  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  34.85 
 
 		 855 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.56 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.94 
 
 		 1045 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  32.11 
 
 		 745 aa  100  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  32.14 
 
 		 381 aa  100  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  36.87 
 
 		 760 aa  100  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  36.45 
 
 		 431 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  33.47 
 
 		 672 aa  99  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.5 
 
 		 525 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  38.92 
 
 		 702 aa  98.6  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 1361 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.71 
 
 		 384 aa  97.8  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  35.32 
 
 		 956 aa  98.2  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1986  putative GAF sensor protein  35.52 
 
 		 798 aa  97.8  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.932658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.93 
 
 		 583 aa  97.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  32.43 
 
 		 685 aa  96.7  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  30.51 
 
 		 642 aa  97.1  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  30.95 
 
 		 851 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  31.72 
 
 		 753 aa  96.7  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  31.08 
 
 		 437 aa  96.7  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  27.95 
 
 		 775 aa  96.7  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 1370 aa  96.7  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  36.45 
 
 		 594 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  36.45 
 
 		 643 aa  96.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  31.22 
 
 		 781 aa  96.3  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  35.75 
 
 		 607 aa  96.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.1 
 
 		 616 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  26.13 
 
 		 362 aa  96.7  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  30.54 
 
 		 688 aa  94.7  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  29.89 
 
 		 642 aa  95.1  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>