299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2800 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2800  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 783 aa  1567    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6994  putative PAS/PAC sensor protein  25.94 
 
 		 797 aa  157  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.28 
 
 		 847 aa  135  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8733  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.28 
 
 		 532 aa  115  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3329  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.93 
 
 		 830 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5852  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.67 
 
 		 424 aa  94  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910285  normal  0.678328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  30.53 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 1385 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  32.92 
 
 		 376 aa  73.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11810  PAS domain S-box  27.4 
 
 		 502 aa  72.8  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  33.53 
 
 		 260 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1818  protein serine/threonine phosphatase  32.86 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 1361 aa  72  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  33.56 
 
 		 828 aa  71.6  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 		 1248 aa  68.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.56 
 
 		 579 aa  67.8  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  31.18 
 
 		 643 aa  67.8  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  31.21 
 
 		 755 aa  67.8  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  27.66 
 
 		 692 aa  67.4  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  31.18 
 
 		 594 aa  67.4  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  29.5 
 
 		 851 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  29.93 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.89 
 
 		 952 aa  65.1  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  28.65 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  30.97 
 
 		 772 aa  64.7  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 		 1070 aa  63.5  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  27.43 
 
 		 649 aa  63.9  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2012  Stage II sporulation E family protein  30.48 
 
 		 612 aa  62.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 1711 aa  62.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  33.56 
 
 		 470 aa  62.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  31.03 
 
 		 1017 aa  61.6  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 		 688 aa  61.6  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.31 
 
 		 1051 aa  61.6  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  28.85 
 
 		 688 aa  61.2  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.5 
 
 		 1390 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.5 
 
 		 1390 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  30.2 
 
 		 672 aa  61.2  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.5 
 
 		 1390 aa  61.2  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.37 
 
 		 738 aa  61.2  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  28.57 
 
 		 713 aa  60.8  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  30 
 
 		 660 aa  60.8  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  27.56 
 
 		 817 aa  60.1  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.05 
 
 		 697 aa  60.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  28.57 
 
 		 365 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.88 
 
 		 1557 aa  60.1  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  26.97 
 
 		 521 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  27.43 
 
 		 697 aa  60.1  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1335  serine phosphatase  23.79 
 
 		 636 aa  59.3  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 1370 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  29.73 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  27.88 
 
 		 753 aa  59.3  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8305  putative PAS/PAC sensor protein  32.67 
 
 		 528 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  30.71 
 
 		 738 aa  59.3  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  27.59 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  27.59 
 
 		 754 aa  58.9  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  29.08 
 
 		 723 aa  58.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  30.14 
 
 		 693 aa  58.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  31.52 
 
 		 1432 aa  57.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.32 
 
 		 743 aa  57.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  25.71 
 
 		 705 aa  58.2  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  22.45 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5042  protein serine/threonine phosphatase  31.58 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.384072  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  29.03 
 
 		 637 aa  57.8  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  29 
 
 		 543 aa  57.4  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  23.65 
 
 		 684 aa  57  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  30.27 
 
 		 676 aa  57.4  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1626  protein serine/threonine phosphatase  35.92 
 
 		 412 aa  57  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.74 
 
 		 750 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3458  putative PAS/PAC sensor protein  27.89 
 
 		 760 aa  57  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0932578 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2096  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.21 
 
 		 953 aa  57  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000903564 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  27.11 
 
 		 744 aa  57  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11395  hypothetical protein  28.4 
 
 		 653 aa  57  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  31.03 
 
 		 570 aa  56.6  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1581  PAS sensor protein  30.51 
 
 		 340 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.12161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.08 
 
 		 1045 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  30.99 
 
 		 846 aa  55.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.79 
 
 		 1332 aa  56.2  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 3706 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 1383 aa  55.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.65 
 
 		 702 aa  55.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3698  Stage II sporulation E family protein  32.03 
 
 		 570 aa  55.1  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1860  PAS sensor protein  30.51 
 
 		 340 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.48 
 
 		 573 aa  55.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  28.12 
 
 		 397 aa  55.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  30.14 
 
 		 591 aa  55.1  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  28.87 
 
 		 537 aa  55.1  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2114  anti-sigma-factor antagonist  33.55 
 
 		 618 aa  54.3  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39314  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2171  protein serine/threonine phosphatase  39.24 
 
 		 389 aa  54.3  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.529271  hitchhiker  0.000569605 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2122  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.4 
 
 		 953 aa  54.3  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0111685  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  30.41 
 
 		 583 aa  53.9  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6569  protein serine/threonine phosphatase  26.11 
 
 		 556 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5306  protein serine/threonine phosphatase  26.98 
 
 		 715 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3484  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.65 
 
 		 395 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.86 
 
 		 1090 aa  53.5  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  26.47 
 
 		 423 aa  53.9  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2019  protein serine/threonine phosphatase  32.21 
 
 		 308 aa  53.5  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  46.77 
 
 		 236 aa  53.5  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0687  putative PAS/PAC sensor protein  30.77 
 
 		 914 aa  53.9  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000503319  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  31.29 
 
 		 465 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.23 
 
 		 549 aa  53.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>