More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0966 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0966  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
518 aa  963    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2585  protein serine/threonine phosphatase  45.05 
 
 
452 aa  187  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00799832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1031  putative GAF sensor protein  33.33 
 
 
525 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3323  serine phosphatase  35.16 
 
 
550 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3385  stage II sporulation E family protein  35.16 
 
 
550 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.0708395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3334  stage II sporulation E family protein  35.16 
 
 
550 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4481  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.5 
 
 
549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00461161  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.91 
 
 
549 aa  164  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5805  putative GAF sensor protein  34.49 
 
 
550 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5090  protein serine/threonine phosphatase  36.2 
 
 
487 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290329  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  39.11 
 
 
694 aa  137  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  40.29 
 
 
693 aa  136  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0145  protein serine/threonine phosphatase  37.55 
 
 
425 aa  133  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  37.35 
 
 
431 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  36.95 
 
 
431 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  36.95 
 
 
431 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  30.57 
 
 
437 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.08 
 
 
655 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  39.75 
 
 
456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  34.17 
 
 
581 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  34.73 
 
 
512 aa  120  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  34.94 
 
 
800 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  33.12 
 
 
377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.32 
 
 
688 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  32.96 
 
 
488 aa  113  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.2 
 
 
728 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  32 
 
 
743 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2893  putative PAS/PAC sensor protein  33.61 
 
 
393 aa  110  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2937  putative PAS/PAC sensor protein  33.61 
 
 
393 aa  110  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  33.83 
 
 
633 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2923  putative PAS/PAC sensor protein  33.43 
 
 
393 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3103  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.23 
 
 
619 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  33.71 
 
 
391 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  35.65 
 
 
697 aa  103  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.74 
 
 
579 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  29.56 
 
 
658 aa  99.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  28.46 
 
 
708 aa  97.1  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2798  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.34 
 
 
538 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  30.8 
 
 
753 aa  94  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  30.25 
 
 
438 aa  93.6  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4050  serine phosphatase  29.14 
 
 
766 aa  93.2  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.18 
 
 
602 aa  92.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.52 
 
 
1332 aa  92  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  30.53 
 
 
688 aa  91.7  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  32.65 
 
 
470 aa  91.3  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2742  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.04 
 
 
438 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0101851  normal  0.919668 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  31.38 
 
 
566 aa  91.3  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.84 
 
 
525 aa  90.9  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.15 
 
 
467 aa  90.1  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.53 
 
 
516 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.05 
 
 
957 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  26.84 
 
 
447 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  30.18 
 
 
574 aa  88.2  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  29.55 
 
 
744 aa  87.8  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.67 
 
 
385 aa  88.2  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  31.58 
 
 
1039 aa  87.8  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  27.73 
 
 
447 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.85 
 
 
388 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  32.58 
 
 
607 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.78 
 
 
447 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  34.45 
 
 
614 aa  85.1  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  30.31 
 
 
765 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.27 
 
 
423 aa  85.1  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  27.8 
 
 
642 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.61 
 
 
1045 aa  84.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  29.79 
 
 
754 aa  84.3  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.44 
 
 
961 aa  84.3  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  31.76 
 
 
634 aa  84  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.75 
 
 
465 aa  83.6  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.97 
 
 
1004 aa  83.6  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  31.15 
 
 
469 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  33.96 
 
 
713 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  32.85 
 
 
709 aa  83.2  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  26.64 
 
 
486 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.16 
 
 
995 aa  82.4  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.17 
 
 
549 aa  82.4  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  26.1 
 
 
706 aa  82.4  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0433  putative PAS/PAC sensor protein  29.82 
 
 
627 aa  81.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546697  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.4 
 
 
572 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  34.12 
 
 
846 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.63 
 
 
553 aa  81.3  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  28.09 
 
 
591 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1109  putative PAS/PAC sensor protein  36.82 
 
 
557 aa  81.3  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  30.42 
 
 
649 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  30.99 
 
 
760 aa  81.3  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  28.33 
 
 
465 aa  80.5  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  29.82 
 
 
688 aa  80.1  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  25.48 
 
 
642 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3857  putative PAS/PAC sensor protein  36.17 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  28.41 
 
 
583 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3698  Stage II sporulation E family protein  31.88 
 
 
570 aa  80.1  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288597  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  29 
 
 
562 aa  79.7  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.54 
 
 
952 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  32.26 
 
 
693 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  27.95 
 
 
817 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  26.74 
 
 
467 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0491  cyclic nucleotide-binding protein  30.17 
 
 
410 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0215963  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6792  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.71 
 
 
585 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.47 
 
 
445 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  32.59 
 
 
455 aa  78.6  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>