More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4050 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4050  serine phosphatase  100 
 
 		 766 aa  1472    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  60.71 
 
 		 800 aa  878    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  35.96 
 
 		 694 aa  304  5.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.82 
 
 		 655 aa  295  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.68 
 
 		 688 aa  259  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  31.97 
 
 		 743 aa  257  5e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.09 
 
 		 728 aa  254  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  39.73 
 
 		 693 aa  244  6e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  37.47 
 
 		 512 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0145  protein serine/threonine phosphatase  35.57 
 
 		 425 aa  187  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  35.21 
 
 		 581 aa  177  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  35.05 
 
 		 377 aa  147  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  32.83 
 
 		 658 aa  145  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  33.79 
 
 		 391 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.02 
 
 		 549 aa  139  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.27 
 
 		 553 aa  138  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3323  serine phosphatase  28.69 
 
 		 550 aa  129  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3385  stage II sporulation E family protein  28.69 
 
 		 550 aa  129  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.0708395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3334  stage II sporulation E family protein  28.69 
 
 		 550 aa  129  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 488 aa  124  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  30.6 
 
 		 431 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  30.6 
 
 		 431 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  30.6 
 
 		 431 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  28.88 
 
 		 437 aa  117  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  28.14 
 
 		 574 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  34.26 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  30.54 
 
 		 633 aa  114  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  30.44 
 
 		 866 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  31.77 
 
 		 760 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  31.62 
 
 		 562 aa  110  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5090  protein serine/threonine phosphatase  31.88 
 
 		 487 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290329  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.21 
 
 		 480 aa  108  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.42 
 
 		 1332 aa  107  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5805  putative GAF sensor protein  30.54 
 
 		 550 aa  107  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.85 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.57 
 
 		 750 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1031  putative GAF sensor protein  29.53 
 
 		 525 aa  105  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.5 
 
 		 957 aa  105  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.73 
 
 		 961 aa  103  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  29.31 
 
 		 713 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.89 
 
 		 467 aa  103  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  28.6 
 
 		 607 aa  102  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  30.49 
 
 		 730 aa  100  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.51 
 
 		 572 aa  100  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.9 
 
 		 573 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  29.76 
 
 		 865 aa  99.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  28.12 
 
 		 547 aa  99.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  29.94 
 
 		 817 aa  97.8  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  27.55 
 
 		 932 aa  97.4  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  30.24 
 
 		 685 aa  96.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  29.14 
 
 		 583 aa  96.3  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.47 
 
 		 579 aa  95.1  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  30.95 
 
 		 453 aa  94.7  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1109  putative PAS/PAC sensor protein  32.25 
 
 		 557 aa  93.2  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.13 
 
 		 616 aa  93.2  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.65 
 
 		 952 aa  92  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  30.32 
 
 		 607 aa  91.7  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  33.92 
 
 		 570 aa  90.9  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  25.36 
 
 		 744 aa  90.9  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  27.41 
 
 		 618 aa  90.1  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  29.89 
 
 		 745 aa  89.7  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2742  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.88 
 
 		 438 aa  89  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0101851  normal  0.919668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  28.98 
 
 		 713 aa  88.2  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3103  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  26.42 
 
 		 619 aa  87.8  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  28.74 
 
 		 470 aa  87.8  8e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.87 
 
 		 748 aa  87.4  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  27.35 
 
 		 754 aa  87.4  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  28.93 
 
 		 753 aa  87  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0376  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 408 aa  87  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000066026  normal  0.449331 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.3 
 
 		 507 aa  86.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  32.39 
 
 		 723 aa  86.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  26.37 
 
 		 465 aa  85.9  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  27.12 
 
 		 1087 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  26.37 
 
 		 465 aa  85.1  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  26.01 
 
 		 566 aa  84.7  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4481  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.19 
 
 		 549 aa  83.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00461161  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  29.34 
 
 		 469 aa  84  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.36 
 
 		 1480 aa  83.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.81 
 
 		 135 aa  83.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  26.81 
 
 		 585 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  29.17 
 
 		 709 aa  83.2  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.48 
 
 		 516 aa  82.4  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  24.09 
 
 		 612 aa  82.4  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1596  serine phosphatase RsbU  25.96 
 
 		 521 aa  82.4  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242086  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  29.73 
 
 		 614 aa  80.5  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3857  putative PAS/PAC sensor protein  29.79 
 
 		 388 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  27.04 
 
 		 765 aa  79.7  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  26.47 
 
 		 1087 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  31.37 
 
 		 543 aa  79  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  27.73 
 
 		 708 aa  78.2  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0617  putative PAS/PAC sensor protein  33.45 
 
 		 580 aa  78.2  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  31.37 
 
 		 776 aa  77.8  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  26.49 
 
 		 594 aa  77.8  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  25.68 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  26.62 
 
 		 591 aa  77.4  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  25.76 
 
 		 687 aa  77.4  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  26.81 
 
 		 631 aa  77.4  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  25.2 
 
 		 477 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.15 
 
 		 378 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28 
 
 		 1045 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>