More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2467 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2467  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
481 aa  988    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  39.92 
 
 
380 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  40.24 
 
 
380 aa  186  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  39.44 
 
 
380 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  39.11 
 
 
380 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  39.11 
 
 
380 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  39.44 
 
 
380 aa  183  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  39.44 
 
 
380 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  39.44 
 
 
380 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  39.44 
 
 
380 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  42.18 
 
 
358 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.209800000000002e-41 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0370  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 
509 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1246  putative PAS/PAC sensor protein  35.09 
 
 
508 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  26.21 
 
 
684 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  27.51 
 
 
775 aa  107  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  28.21 
 
 
642 aa  97.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  31.03 
 
 
395 aa  94.4  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  26.74 
 
 
409 aa  94  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  29.55 
 
 
642 aa  94  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2893  putative PAS/PAC sensor protein  27.5 
 
 
393 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2937  putative PAS/PAC sensor protein  27.5 
 
 
393 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2923  putative PAS/PAC sensor protein  27.5 
 
 
393 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.5 
 
 
1248 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1516  putative PAS/PAC sensor protein  24.59 
 
 
545 aa  86.7  9e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00955123  decreased coverage  0.00000000236227 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  28.46 
 
 
708 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  28.05 
 
 
378 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.97 
 
 
526 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  30.33 
 
 
472 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.35 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  28.16 
 
 
574 aa  85.1  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  29.89 
 
 
846 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  30.24 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0772  protein serine/threonine phosphatase  26.19 
 
 
340 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155519  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  22.71 
 
 
754 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  25.45 
 
 
649 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.93 
 
 
590 aa  81.3  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  28.69 
 
 
1087 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  26.38 
 
 
866 aa  80.9  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.29 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  27.18 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  31.6 
 
 
634 aa  80.5  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  25.64 
 
 
362 aa  79.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  23.93 
 
 
637 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.54 
 
 
602 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1424  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.89 
 
 
496 aa  79  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  25.95 
 
 
685 aa  77.8  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.95 
 
 
384 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  27.14 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  26.26 
 
 
361 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  27.89 
 
 
1087 aa  77  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  29.26 
 
 
853 aa  77  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.89 
 
 
1045 aa  76.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  27.07 
 
 
1082 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  25.52 
 
 
536 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  29.52 
 
 
706 aa  76.3  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  26.27 
 
 
260 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  24.12 
 
 
364 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  24.74 
 
 
443 aa  76.6  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  24.91 
 
 
637 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  27.65 
 
 
1083 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  27.8 
 
 
760 aa  75.1  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.3 
 
 
423 aa  74.7  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  25.17 
 
 
519 aa  74.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.52 
 
 
470 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1749  putative PAS/PAC sensor protein  23.18 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000958902  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  27.63 
 
 
535 aa  73.6  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  27.17 
 
 
687 aa  73.2  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
1370 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0279  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.81 
 
 
394 aa  72.8  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1702  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.62 
 
 
460 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0812  Stage II sporulation E family protein  27.8 
 
 
422 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  27.38 
 
 
1079 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2078  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.71 
 
 
379 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.57 
 
 
486 aa  72.4  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 
1711 aa  71.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2742  protein phosphatase 2C domain-containing protein  26.95 
 
 
438 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0101851  normal  0.919668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  27.41 
 
 
683 aa  71.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  27.78 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3351  stage II sporulation E family protein  30.12 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.57 
 
 
549 aa  71.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2647  response regulator receiver protein  29.9 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0228439  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.46 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1521  protein serine/threonine phosphatase  28.37 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  26.13 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  26.03 
 
 
618 aa  70.9  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.07 
 
 
445 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0329  putative response regulator  24.79 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.78 
 
 
560 aa  70.5  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  27.88 
 
 
776 aa  70.5  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  26.12 
 
 
851 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  26.56 
 
 
438 aa  70.5  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4640  putative PAS/PAC sensor protein  23.59 
 
 
427 aa  70.1  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.74459  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  27.62 
 
 
469 aa  70.5  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  25.09 
 
 
716 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1479  response regulator receiver protein  28.29 
 
 
402 aa  70.5  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  23.53 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3857  putative PAS/PAC sensor protein  27.11 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  27.83 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2345  rsbU-related protein  32.09 
 
 
249 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>