More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0192 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0192  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
471 aa  939    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1096  serine/threonine protein kinase  47.65 
 
 
413 aa  240  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1172  serine/threonine protein kinase  44.37 
 
 
396 aa  236  6e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000010841 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5076  serine/threonine protein kinase  46.76 
 
 
431 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2408  serine/threonine protein kinase  44.81 
 
 
290 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.155652  hitchhiker  0.00744313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.27 
 
 
1965 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1920  serine/threonine protein kinase  41.33 
 
 
338 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0363  serine/threonine protein kinase  46.27 
 
 
497 aa  176  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2551  ATP-binding region ATPase domain protein  46.06 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4540  serine/threonine protein kinase  42.8 
 
 
444 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.261532  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0395  serine/threonine protein kinase  42.75 
 
 
420 aa  171  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3828  serine/threonine protein kinase  39.38 
 
 
291 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3401  serine/threonine protein kinase  43.02 
 
 
460 aa  160  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4035  serine/threonine protein kinase  39.53 
 
 
295 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  48.1 
 
 
343 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.71 
 
 
681 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.06 
 
 
614 aa  152  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  46.75 
 
 
316 aa  151  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  40.7 
 
 
502 aa  150  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  38.49 
 
 
464 aa  149  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4831  serine/threonine protein kinase  37.93 
 
 
289 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.03 
 
 
321 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 
1550 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0329  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.87 
 
 
336 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.832493  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1974  diguanylate cyclase  44.87 
 
 
336 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.588528 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.7 
 
 
326 aa  143  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1946  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  44.16 
 
 
722 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3260  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.33 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.16 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  37.46 
 
 
646 aa  141  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.58 
 
 
641 aa  141  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  39.55 
 
 
615 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  41.15 
 
 
581 aa  140  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.89 
 
 
681 aa  140  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2072  signal transduction histidine kinase  47.02 
 
 
829 aa  140  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  40.62 
 
 
732 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  44.44 
 
 
276 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  35.06 
 
 
425 aa  139  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.59 
 
 
676 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4535  putative GAF sensor protein  47.09 
 
 
251 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  34.83 
 
 
468 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02127  sensor histidine kinase  44.64 
 
 
398 aa  138  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2479  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.68 
 
 
531 aa  138  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838154  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  42.5 
 
 
327 aa  139  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 
267 aa  139  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 
562 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  39.49 
 
 
542 aa  137  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  36.09 
 
 
790 aa  137  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0961  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.22 
 
 
465 aa  137  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  46.05 
 
 
595 aa  137  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4722  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.22 
 
 
323 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15571  GAF domain-containing protein  39.35 
 
 
249 aa  136  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414818  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  37.23 
 
 
460 aa  136  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  39.1 
 
 
249 aa  136  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  46.75 
 
 
728 aa  136  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15351  GAF domain-containing protein  38.71 
 
 
238 aa  136  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0730  serine/threonine protein kinase  38.7 
 
 
464 aa  136  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15721  GAF domain-containing protein  39.35 
 
 
249 aa  136  9e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  33.57 
 
 
457 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0066  GGDEF domain-containing protein  44.59 
 
 
743 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928161  normal  0.0154172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6199  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  46.11 
 
 
740 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  46.75 
 
 
934 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0966  diguanylate cyclase  42.31 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  37.85 
 
 
661 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  36.27 
 
 
1479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3060  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  46.84 
 
 
442 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  35.98 
 
 
763 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  44.52 
 
 
321 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0918  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.67 
 
 
323 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.63 
 
 
584 aa  134  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.43 
 
 
647 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  36.73 
 
 
662 aa  134  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 
680 aa  134  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3444  diguanylate cyclase  42.67 
 
 
323 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.33 
 
 
653 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.31 
 
 
743 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.766687  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  35.21 
 
 
477 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  39.33 
 
 
618 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  34.93 
 
 
766 aa  134  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.14 
 
 
635 aa  133  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3037  GGDEF domain-containing protein  39.47 
 
 
320 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.46 
 
 
662 aa  133  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0894  diguanylate cyclase  42 
 
 
323 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.499341  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.42 
 
 
506 aa  133  7.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  35.46 
 
 
503 aa  133  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.85 
 
 
603 aa  133  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  35.92 
 
 
634 aa  132  9e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.67 
 
 
319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
612 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3085  diguanylate cyclase  40.67 
 
 
323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1877  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  42.42 
 
 
722 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  41.14 
 
 
512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3036  Serine/threonine protein kinase-related protein  39.29 
 
 
406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  37.08 
 
 
668 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  32.99 
 
 
621 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  36.23 
 
 
528 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  47.92 
 
 
930 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.62 
 
 
946 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7959  signal transduction histidine kinase  43.11 
 
 
416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  35.66 
 
 
470 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>