More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02127 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02127  sensor histidine kinase  100 
 
 		 398 aa  803    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 401 aa  226  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  33.42 
 
 		 542 aa  215  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2310  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  34.47 
 
 		 400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08061  hypothetical protein  33.33 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.32 
 
 		 1550 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4535  putative GAF sensor protein  58.18 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  58.62 
 
 		 677 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  55.19 
 
 		 512 aa  182  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  50.76 
 
 		 897 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  57.41 
 
 		 1224 aa  179  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  56.77 
 
 		 1002 aa  178  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  53.85 
 
 		 1001 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 		 662 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  50.78 
 
 		 343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08056  hypothetical protein  28.68 
 
 		 407 aa  172  6.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  50 
 
 		 506 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5599  signal transduction histidine kinase  52.73 
 
 		 389 aa  170  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  51.41 
 
 		 500 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7959  signal transduction histidine kinase  52.47 
 
 		 416 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5586  signal transduction histidine kinase  52.47 
 
 		 390 aa  166  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  50.85 
 
 		 500 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  54.43 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  41.49 
 
 		 1041 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  50.6 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5220  putative GAF sensor protein  54.22 
 
 		 182 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.583285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2551  ATP-binding region ATPase domain protein  32.65 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 1016 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  54.32 
 
 		 934 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2072  signal transduction histidine kinase  47.85 
 
 		 829 aa  163  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3974  signal transduction histidine kinase  49.1 
 
 		 635 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0272817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0961  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.24 
 
 		 465 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1229  diguanylate cyclase  48.1 
 
 		 356 aa  157  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586021  normal  0.0822929 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0118  HWE histidine kinase  49.7 
 
 		 538 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  55.03 
 
 		 930 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.85 
 
 		 946 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  55.03 
 
 		 930 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  52.56 
 
 		 929 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3195  sensor histidine kinase  30.99 
 
 		 438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211172  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  47.13 
 
 		 249 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  50.97 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.42 
 
 		 943 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15351  GAF domain-containing protein  45.57 
 
 		 238 aa  153  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0792  hypothetical protein  50.3 
 
 		 240 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.327217  normal  0.0268431 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15571  GAF domain-containing protein  45.22 
 
 		 249 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414818  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  46.84 
 
 		 1191 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2863  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 422 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.1 
 
 		 837 aa  150  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15721  GAF domain-containing protein  45.22 
 
 		 249 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1559  hypothetical protein  48.08 
 
 		 245 aa  150  5e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 		 653 aa  149  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17911  GAF domain-containing protein  47.8 
 
 		 253 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0934  hypothetical protein  47.8 
 
 		 253 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.09 
 
 		 864 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.45 
 
 		 680 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  50.64 
 
 		 326 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  43.65 
 
 		 316 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3263  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  49.67 
 
 		 669 aa  147  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.85 
 
 		 1965 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4251  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.95 
 
 		 603 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1854  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.93 
 
 		 579 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.46631 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04157  histidine kinase-response regulator hybrid protein  49.03 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.851557  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4722  diguanylate cyclase with GAF sensor  47.4 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.7 
 
 		 1309 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2479  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.72 
 
 		 531 aa  144  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838154  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3828  putative GAF sensor protein  45.73 
 
 		 226 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3060  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  46.86 
 
 		 442 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.57 
 
 		 640 aa  143  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 890 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  46.79 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.83 
 
 		 681 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.32 
 
 		 319 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  40.94 
 
 		 797 aa  139  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0192  serine/threonine protein kinase  44.64 
 
 		 471 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10742  predicted protein  52.05 
 
 		 153 aa  138  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 941 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0066  GGDEF domain-containing protein  46.25 
 
 		 743 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928161  normal  0.0154172 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3496  hypothetical protein  50 
 
 		 497 aa  138  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.676733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04155  Putative signal protein with GAF,PAS(PAC) and GGDEF domains  43.83 
 
 		 874 aa  137  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.581833  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48 
 
 		 624 aa  136  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.533876  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0665  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  41.28 
 
 		 727 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.545647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1946  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  43.75 
 
 		 722 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146362  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.95 
 
 		 348 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.95 
 
 		 348 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  46.5 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5440  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 407 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235159  normal  0.434516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2109  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.64 
 
 		 599 aa  133  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.75 
 
 		 743 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.766687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3158  diguanylate cyclase  42.67 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2267  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0108452  hitchhiker  0.000000348318 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 		 878 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3513  diguanylate cyclase with GAF sensor  42 
 
 		 326 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.668666  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3776  hypothetical protein  46.2 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306006 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  43.79 
 
 		 276 aa  131  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2479  putative GAF sensor protein  43.83 
 
 		 363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.376583 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3037  GGDEF domain-containing protein  33.59 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  45.68 
 
 		 595 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  43.11 
 
 		 267 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>