279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04157 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04157  histidine kinase-response regulator hybrid protein  100 
 
 
306 aa  612  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.851557  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2310  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  46.15 
 
 
400 aa  172  6.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3828  putative GAF sensor protein  49.03 
 
 
226 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  50.62 
 
 
367 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0961  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.22 
 
 
465 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3060  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  50 
 
 
442 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1559  hypothetical protein  45 
 
 
245 aa  151  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4251  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.15 
 
 
603 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3496  hypothetical protein  53.08 
 
 
497 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.676733  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08061  hypothetical protein  39.68 
 
 
406 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3195  sensor histidine kinase  49.68 
 
 
438 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211172  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  47.65 
 
 
321 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  46.95 
 
 
401 aa  146  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  43.21 
 
 
542 aa  146  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02127  sensor histidine kinase  49.03 
 
 
398 aa  145  9e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  43.12 
 
 
249 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15351  GAF domain-containing protein  42.14 
 
 
238 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2072  signal transduction histidine kinase  45.62 
 
 
829 aa  142  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 
1309 aa  142  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.65 
 
 
506 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15571  GAF domain-containing protein  41.51 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414818  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 
897 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15721  GAF domain-containing protein  41.51 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  45.34 
 
 
500 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08056  hypothetical protein  34.74 
 
 
407 aa  139  7e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  45.81 
 
 
343 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
640 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  46.9 
 
 
321 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  48.08 
 
 
934 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  44.72 
 
 
500 aa  136  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2109  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.95 
 
 
599 aa  135  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161845  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1229  diguanylate cyclase  41.1 
 
 
356 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586021  normal  0.0822929 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 
1001 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5220  putative GAF sensor protein  47.77 
 
 
182 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.583285  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.41 
 
 
1550 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  45.62 
 
 
929 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  49.32 
 
 
930 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  49.32 
 
 
930 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
1002 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.21 
 
 
326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
890 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6199  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  40 
 
 
740 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  32.87 
 
 
797 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4535  putative GAF sensor protein  45 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17911  GAF domain-containing protein  41.36 
 
 
253 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.22 
 
 
864 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10742  predicted protein  43.62 
 
 
153 aa  126  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182467  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0934  hypothetical protein  41.36 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04155  Putative signal protein with GAF,PAS(PAC) and GGDEF domains  44.37 
 
 
874 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.581833  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.77 
 
 
946 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 
681 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.52 
 
 
319 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4722  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.33 
 
 
323 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 
878 aa  122  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 
662 aa  122  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 
437 aa  122  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0792  hypothetical protein  39.38 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.327217  normal  0.0268431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0118  HWE histidine kinase  43.29 
 
 
538 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.95 
 
 
1965 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4543  GAF domain/GGDEF domain/EAL domain protein  38.96 
 
 
607 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38768  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
837 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3138  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.55 
 
 
345 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  38.76 
 
 
1041 aa  119  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 
1016 aa  119  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3974  signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 
635 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0272817 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2505  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  39.44 
 
 
345 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.430442  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 
677 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0192  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
471 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 
943 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3217  diguanylate cyclase  38.89 
 
 
345 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.201545  normal  0.0694192 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  40.13 
 
 
595 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 
1191 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 
399 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2479  putative GAF sensor protein  42.24 
 
 
363 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.376583 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.25 
 
 
1125 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  43.79 
 
 
603 aa  116  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0812  Stage II sporulation E family protein  46.56 
 
 
422 aa  115  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4396  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  35.67 
 
 
594 aa  115  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.898588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  35.76 
 
 
732 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4221  EAL:GAF  37.66 
 
 
607 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5599  signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0181  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  47.29 
 
 
737 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3037  GGDEF domain-containing protein  40.69 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7959  signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 
416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2664  cyclic diguanylate phosphodiesterase/diguanylate cyclase  41.98 
 
 
600 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1946  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.11 
 
 
722 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146362  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.74 
 
 
653 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
941 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3513  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.83 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.668666  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.06 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.06 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.68 
 
 
728 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 
697 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3158  diguanylate cyclase  29.97 
 
 
325 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  39.62 
 
 
1125 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5586  signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 
390 aa  112  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3260  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.05 
 
 
327 aa  113  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2463  hypothetical protein  37.63 
 
 
341 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.162594  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.27 
 
 
624 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.533876  normal  0.201744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>