More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4347 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  100 
 
 
576 aa  1101    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.21 
 
 
775 aa  300  5e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  43.88 
 
 
544 aa  238  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0659  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  41.69 
 
 
450 aa  224  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808889  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  47.68 
 
 
652 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0750  putative PAS/PAC sensor protein  41.9 
 
 
546 aa  208  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.0245877 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4640  putative PAS/PAC sensor protein  45.39 
 
 
427 aa  197  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.74459  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  44.49 
 
 
585 aa  195  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  40.69 
 
 
562 aa  195  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  47.43 
 
 
865 aa  194  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13090  Stage II sporulation protein E (SpoIIE)  38.3 
 
 
576 aa  193  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  43.77 
 
 
607 aa  189  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  43.81 
 
 
614 aa  188  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40.82 
 
 
553 aa  186  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  45.45 
 
 
685 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  40.52 
 
 
932 aa  183  8.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0433  putative PAS/PAC sensor protein  44.82 
 
 
627 aa  183  8.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546697  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  42.08 
 
 
574 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  43.67 
 
 
547 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  41.72 
 
 
866 aa  181  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  44.71 
 
 
583 aa  177  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  44.96 
 
 
770 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  45.56 
 
 
692 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  40.93 
 
 
618 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  40.34 
 
 
760 aa  171  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  41.69 
 
 
572 aa  169  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  36.04 
 
 
607 aa  169  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  43.39 
 
 
956 aa  167  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0106  PAS protein phosphatase 2C-like  39.66 
 
 
670 aa  162  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06030  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  42.11 
 
 
567 aa  160  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486099  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  34.6 
 
 
702 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  40.79 
 
 
570 aa  156  8e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  36.01 
 
 
723 aa  156  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  40.52 
 
 
730 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2019  protein serine/threonine phosphatase  40.39 
 
 
308 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  38.07 
 
 
930 aa  148  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  42.41 
 
 
312 aa  144  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  41.44 
 
 
757 aa  143  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  39.71 
 
 
364 aa  143  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 
1248 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.93 
 
 
560 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
1711 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.88 
 
 
1051 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  38.33 
 
 
828 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  35.57 
 
 
745 aa  140  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0617  putative PAS/PAC sensor protein  38.22 
 
 
580 aa  139  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.52 
 
 
697 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 
1171 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  32.1 
 
 
700 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  35.13 
 
 
709 aa  134  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  31.01 
 
 
817 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  31.59 
 
 
688 aa  133  9e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 
441 aa  133  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  34.9 
 
 
697 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.14 
 
 
441 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  35.52 
 
 
1039 aa  133  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0207  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.46 
 
 
613 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2895  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.5 
 
 
539 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.939958  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  37.59 
 
 
746 aa  131  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  31.58 
 
 
693 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.36 
 
 
579 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
1361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  34.55 
 
 
692 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  40.28 
 
 
851 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  37.76 
 
 
771 aa  127  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  34.13 
 
 
688 aa  127  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.64 
 
 
1390 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  32.32 
 
 
721 aa  126  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.64 
 
 
1390 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.64 
 
 
1390 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  37.08 
 
 
716 aa  124  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
1385 aa  124  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  36.49 
 
 
693 aa  123  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.05 
 
 
549 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.39 
 
 
616 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
1370 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  35.74 
 
 
1432 aa  120  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  35.69 
 
 
591 aa  117  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  33.22 
 
 
713 aa  117  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  33.98 
 
 
594 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6994  putative PAS/PAC sensor protein  35.97 
 
 
797 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126059  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 
676 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  33.98 
 
 
643 aa  115  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  38.89 
 
 
260 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  29.22 
 
 
672 aa  114  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
1383 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1854  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.65 
 
 
579 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.46631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.64 
 
 
1045 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  37.05 
 
 
1017 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  34.81 
 
 
537 aa  110  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  35.8 
 
 
453 aa  110  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4113  diguanylate cyclase  43.75 
 
 
349 aa  110  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0357706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.3 
 
 
523 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.97 
 
 
529 aa  108  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  35.14 
 
 
391 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  36.27 
 
 
753 aa  107  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  34.47 
 
 
744 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  33.14 
 
 
573 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  36.3 
 
 
693 aa  106  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3606  protein serine/threonine phosphatase  35.84 
 
 
395 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>