More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0128 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  100 
 
 		 728 aa  1442    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4113  putative PAS/PAC sensor protein  39.18 
 
 		 896 aa  354  4e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  36.25 
 
 		 1081 aa  333  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  38.14 
 
 		 982 aa  327  5e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.47 
 
 		 700 aa  326  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.84 
 
 		 712 aa  316  8e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3382  putative PAS/PAC sensor protein  33.95 
 
 		 952 aa  293  5e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  33.73 
 
 		 1969 aa  285  3.0000000000000004e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2813  putative PAS/PAC sensor protein  35.66 
 
 		 991 aa  275  3e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0683  putative PAS/PAC sensor protein  32.41 
 
 		 750 aa  271  4e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987157  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  33.79 
 
 		 1589 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  35.53 
 
 		 919 aa  256  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0043  putative PAS/PAC sensor protein  32.39 
 
 		 1216 aa  245  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  32.38 
 
 		 1059 aa  242  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1541  putative PAS/PAC sensor protein  37.2 
 
 		 1071 aa  241  5e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.86 
 
 		 637 aa  239  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.55 
 
 		 564 aa  239  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1012  putative PAS/PAC sensor protein  35.9 
 
 		 1154 aa  235  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0819572  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  34.65 
 
 		 532 aa  227  5.0000000000000005e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  33.5 
 
 		 994 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5215  putative PAS/PAC sensor protein  35.02 
 
 		 677 aa  208  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  35.06 
 
 		 553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5264  putative PAS/PAC sensor protein  33.82 
 
 		 1073 aa  194  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.255684  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0977  putative PAS/PAC sensor protein  32.68 
 
 		 737 aa  188  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  31.83 
 
 		 781 aa  183  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1371  putative PAS/PAC sensor protein  31.66 
 
 		 834 aa  180  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3905  putative PAS/PAC sensor protein  31.38 
 
 		 537 aa  178  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  30.49 
 
 		 644 aa  177  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  28.14 
 
 		 843 aa  174  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  30.12 
 
 		 680 aa  171  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1747  putative PAS/PAC sensor protein  32.69 
 
 		 524 aa  169  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3168  putative PAS/PAC sensor protein  30.58 
 
 		 807 aa  164  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3054  putative PAS/PAC sensor protein  25.46 
 
 		 1260 aa  155  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3065  putative PAS/PAC sensor protein  31.31 
 
 		 770 aa  151  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  28.99 
 
 		 666 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1305  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.79 
 
 		 598 aa  128  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  29.95 
 
 		 539 aa  122  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 746 aa  120  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0209  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 546 aa  120  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.59 
 
 		 634 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 896 aa  117  7.999999999999999e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.5 
 
 		 769 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.28 
 
 		 500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4231  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.89 
 
 		 357 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113145  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3357  response regulator receiver protein  48.68 
 
 		 283 aa  112  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.83 
 
 		 759 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.69 
 
 		 653 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 		 490 aa  108  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 389 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 389 aa  107  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 759 aa  107  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 682 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 		 553 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 683 aa  105  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1870  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.79 
 
 		 346 aa  103  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181656  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1126  response regulator receiver modulated serine phosphatase  42.68 
 
 		 451 aa  103  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4150  response regulator receiver protein  42.78 
 
 		 291 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0666389 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 653 aa  101  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1035  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.45 
 
 		 242 aa  99.4  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0557588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  41.22 
 
 		 492 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  41.22 
 
 		 492 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 492 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  41.22 
 
 		 492 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  41.22 
 
 		 492 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5033  response regulator receiver modulated serine phosphatase  44.22 
 
 		 389 aa  98.6  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5111  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.6 
 
 		 479 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 386 aa  95.9  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  30.65 
 
 		 906 aa  95.5  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 1032 aa  95.1  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2987  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 391 aa  94.7  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143541  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 		 874 aa  94.4  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  45.63 
 
 		 463 aa  94.4  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 783 aa  94  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  45.71 
 
 		 463 aa  93.6  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  45.71 
 
 		 463 aa  93.6  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.58 
 
 		 251 aa  93.2  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1537  putative PAS/PAC sensor protein  31.35 
 
 		 636 aa  93.2  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4645  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 644 aa  91.7  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1202  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.57 
 
 		 1126 aa  91.3  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.766255  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3484  response regulator receiver modulated serine phosphatase  41.67 
 
 		 395 aa  91.3  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3268  response regulator receiver protein  38.62 
 
 		 391 aa  90.9  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1325  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.5 
 
 		 233 aa  90.5  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 1325 aa  90.5  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.21 
 
 		 776 aa  90.1  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1653  guanylate cyclase  38.96 
 
 		 433 aa  89.7  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.181095  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2043  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 433 aa  89.7  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 773 aa  89  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.31 
 
 		 434 aa  88.6  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1263  response regulator receiver modulated serine phosphatase  42.48 
 
 		 425 aa  88.6  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.799731  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 659 aa  87.4  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22970  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  38.1 
 
 		 423 aa  87.4  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.376006 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  32.95 
 
 		 440 aa  87.4  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1127  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.4 
 
 		 989 aa  86.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6523  response regulator receiver modulated serine phosphatase  40.94 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98735  normal  0.0636909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2344  response regulator receiver:protein phosphatase 2C-like  39.72 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0665  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.25 
 
 		 1051 aa  84.7  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3213  two-component hybrid sensor and regulator  33.11 
 
 		 359 aa  83.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2688  response regulator receiver modulated serine phosphatase  38.75 
 
 		 407 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2718  response regulator receiver protein  38.75 
 
 		 407 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453118  normal  0.333299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>