More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6523 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6523  response regulator receiver modulated serine phosphatase  100 
 
 
422 aa  807    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98735  normal  0.0636909 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0290  response regulator receiver modulated serine phosphatase  82.98 
 
 
390 aa  574  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.639758  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1126  response regulator receiver modulated serine phosphatase  53.83 
 
 
451 aa  342  1e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5033  response regulator receiver modulated serine phosphatase  50.79 
 
 
389 aa  325  7e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2344  response regulator receiver:protein phosphatase 2C-like  48.43 
 
 
409 aa  318  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8460  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  53.52 
 
 
394 aa  313  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5361  response regulator receiver modulated serine phosphatase  51.32 
 
 
392 aa  300  4e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155785  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0442  response regulator receiver modulated serine phosphatase  50.26 
 
 
421 aa  296  6e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723738  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2688  response regulator receiver modulated serine phosphatase  47.16 
 
 
407 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2732  response regulator receiver protein  47.16 
 
 
407 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276002  normal  0.519614 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2718  response regulator receiver protein  47.16 
 
 
407 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453118  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1576  response regulator receiver modulated serine phosphatase  51.17 
 
 
406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0296276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3484  response regulator receiver modulated serine phosphatase  45.5 
 
 
395 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1263  response regulator receiver modulated serine phosphatase  44.53 
 
 
425 aa  261  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.799731  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0056  response regulator receiver modulated serine phosphatase  46.3 
 
 
418 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287626  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2987  response regulator receiver protein  45.22 
 
 
391 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143541  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22970  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  43.56 
 
 
423 aa  245  8e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3268  response regulator receiver protein  45.18 
 
 
391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.97 
 
 
634 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.78 
 
 
490 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.39 
 
 
759 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  43.55 
 
 
746 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  23.85 
 
 
380 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.36 
 
 
380 aa  94  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  23.59 
 
 
380 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4231  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.14 
 
 
357 aa  93.6  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113145  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.83 
 
 
653 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  23.85 
 
 
380 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  23.59 
 
 
380 aa  92.8  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.78 
 
 
847 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  24.62 
 
 
380 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  24.32 
 
 
358 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.209800000000002e-41 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  45.31 
 
 
386 aa  90.5  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 
682 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  23.97 
 
 
380 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5111  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.69 
 
 
479 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  24.25 
 
 
380 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.9 
 
 
500 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  24.25 
 
 
380 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 
769 aa  87.4  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.15 
 
 
688 aa  86.3  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.98 
 
 
384 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  40.94 
 
 
728 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  44.53 
 
 
492 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  44.53 
 
 
492 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  44.53 
 
 
492 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  44.53 
 
 
492 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  43.45 
 
 
492 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 
553 aa  84  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4150  response regulator receiver protein  47.48 
 
 
291 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0666389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.53 
 
 
396 aa  84  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3357  response regulator receiver protein  45.9 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  33.6 
 
 
456 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  40.56 
 
 
529 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  33.21 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.35 
 
 
616 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.79 
 
 
549 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  36.71 
 
 
453 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0376  putative PAS/PAC sensor protein  33.21 
 
 
408 aa  81.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000066026  normal  0.449331 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  34.23 
 
 
512 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.95 
 
 
560 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1653  guanylate cyclase  45.08 
 
 
433 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.181095  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3698  Stage II sporulation E family protein  33.19 
 
 
570 aa  80.1  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288597  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  31.3 
 
 
637 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0308  putative response regulator  24.31 
 
 
506 aa  79.7  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.54 
 
 
525 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  39.1 
 
 
637 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  34.66 
 
 
693 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 
389 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 
874 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.68 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4645  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 
644 aa  77.8  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224961  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5090  protein serine/threonine phosphatase  35.48 
 
 
487 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290329  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.3 
 
 
728 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  32.3 
 
 
437 aa  77  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  25.19 
 
 
394 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  29.78 
 
 
697 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2798  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.74 
 
 
538 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  30.56 
 
 
781 aa  75.5  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  26.77 
 
 
378 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  25.19 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  29.09 
 
 
743 aa  74.7  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  29.81 
 
 
688 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  26.57 
 
 
574 aa  74.7  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.06 
 
 
602 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  50.56 
 
 
463 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  50.56 
 
 
463 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  35.15 
 
 
1432 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30 
 
 
697 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8733  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.38 
 
 
532 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1869  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 
553 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  25.37 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.24 
 
 
549 aa  73.6  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  29.8 
 
 
676 aa  73.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 
647 aa  73.6  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0833  response regulator  29.2 
 
 
389 aa  73.6  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106584  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  49.44 
 
 
463 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  27.56 
 
 
1079 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>