103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0620 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0620  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
390 aa  782    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0617  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30 
 
 
830 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4425  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.06 
 
 
1143 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4489  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.06 
 
 
1143 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4938  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.45 
 
 
1027 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.393519 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4645  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.57 
 
 
644 aa  89.7  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224961  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
845 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0862  response regulator receiver protein  39.08 
 
 
293 aa  87  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.747276  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4150  response regulator receiver protein  34.67 
 
 
291 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0666389 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3626  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.96 
 
 
840 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1286  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.43 
 
 
706 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.780244 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2110  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  28.52 
 
 
814 aa  84  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406671  normal  0.904687 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3932  response regulator receiver protein  43.4 
 
 
298 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3981  response regulator receiver protein  43.4 
 
 
298 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000307852  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3357  response regulator receiver protein  35.09 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1431  sigma54 specific transcriptional regulator with PAS/PAC sensor, Fis family  35.26 
 
 
806 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.333003  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0343  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.01 
 
 
819 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0947891  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3004  response regulator receiver protein  37.74 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 
509 aa  77.4  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.490677  normal  0.372595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
1516 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2187  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.65 
 
 
593 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.1316 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3572  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.62 
 
 
658 aa  73.6  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4406  putative PAS/PAC sensor protein  38.38 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4469  putative PAS/PAC sensor protein  38.38 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1618  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.01 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.465864  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 
1261 aa  73.2  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1859  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.89 
 
 
917 aa  72.8  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.18 
 
 
1306 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
412 aa  69.7  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.111362 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0057  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.71 
 
 
836 aa  68.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2480  histidine kinase  35.37 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.90361  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 
1959 aa  66.6  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2176  diguanylate cyclase  30.77 
 
 
304 aa  65.9  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000143652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
1021 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0471  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.56 
 
 
572 aa  64.7  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.634401  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3293  NarL family two-component response regulator  29.22 
 
 
275 aa  63.5  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3356  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
401 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0389  histidine kinase  35.35 
 
 
557 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1121  diguanylate cyclase  27.13 
 
 
305 aa  62.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.323017 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  34.15 
 
 
553 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1328  histidine kinase  33.94 
 
 
672 aa  60.1  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
874 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3296  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
650 aa  59.7  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0616  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.44 
 
 
908 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0119428 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1118  hypothetical protein  24.65 
 
 
780 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  30.7 
 
 
359 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1114  hypothetical protein  24.65 
 
 
775 aa  57  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3581  GGDEF domain-containing protein  32.23 
 
 
312 aa  56.6  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3905  putative PAS/PAC sensor protein  32.48 
 
 
537 aa  56.6  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3012  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.28 
 
 
619 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299906  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0735  putative PAS/PAC sensor protein  31.88 
 
 
512 aa  53.9  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  26.52 
 
 
853 aa  52.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.85 
 
 
929 aa  51.2  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.968718  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  28.57 
 
 
823 aa  50.8  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3752  histidine kinase  30.08 
 
 
135 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0720825  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4119  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 
380 aa  50.8  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2785  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.51 
 
 
648 aa  50.4  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0196  putative PAS/PAC sensor protein  33.8 
 
 
365 aa  50.4  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1809  putative PAS/PAC sensor protein  27.73 
 
 
868 aa  49.7  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 
807 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 
600 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.3 
 
 
841 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1705  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.09 
 
 
686 aa  48.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.584418  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
973 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4358  hypothetical protein  30.63 
 
 
279 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798369  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.18 
 
 
464 aa  47.4  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.9 
 
 
1007 aa  47  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
773 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4603  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.47 
 
 
783 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1429  diguanylate cyclase  29.01 
 
 
306 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190183 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0928  GGDEF domain-containing protein  28.43 
 
 
317 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1156  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.57 
 
 
469 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.23 
 
 
727 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
662 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1750  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  26.58 
 
 
896 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.42554 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 
1111 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0157  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
1329 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  26.59 
 
 
480 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.07 
 
 
1559 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 
1060 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 
765 aa  43.9  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2512  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  29.63 
 
 
1065 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612472  normal  0.56879 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3739  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.34 
 
 
796 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84423  hitchhiker  0.00115944 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2750  putative PAS/PAC sensor protein  30.19 
 
 
883 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1952  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  24.23 
 
 
545 aa  43.9  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.51 
 
 
1419 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1399  two component sensor histidine kinase  25.81 
 
 
565 aa  43.5  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 
472 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  24.55 
 
 
474 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
1721 aa  43.5  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0071  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.03 
 
 
697 aa  43.5  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0758  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 
800 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 
801 aa  43.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.68 
 
 
1309 aa  43.1  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  23.84 
 
 
1338 aa  43.1  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
498 aa  43.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.988505  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
638 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3503  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.71 
 
 
1101 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
731 aa  43.1  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>