More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2434 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 662 aa  1312    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 1029 aa  286  9e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 785 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  32.99 
 
 		 1023 aa  258  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 874 aa  232  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3769  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 710 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.15 
 
 		 1223 aa  213  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0185  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 		 691 aa  207  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483444  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 1068 aa  200  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 1090 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 1090 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 		 881 aa  189  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3236  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.59 
 
 		 725 aa  187  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.142395 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 568 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 		 646 aa  181  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 643 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 646 aa  179  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0393x  response regulator, histidine kinase  32.38 
 
 		 943 aa  180  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621999  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 		 674 aa  177  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  30.87 
 
 		 1629 aa  177  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  29.96 
 
 		 823 aa  177  7e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.16 
 
 		 1352 aa  176  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 418 aa  176  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  33.08 
 
 		 648 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 		 947 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  43.81 
 
 		 1074 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0962  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 823 aa  172  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 874 aa  171  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  32.76 
 
 		 882 aa  171  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0796  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  50.29 
 
 		 765 aa  171  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.341606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 		 865 aa  171  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 		 1053 aa  170  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  43.75 
 
 		 508 aa  170  9e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 456 aa  169  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2314  histidine kinase  42.21 
 
 		 487 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 1038 aa  169  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 		 1121 aa  167  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 		 767 aa  168  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2758  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 		 857 aa  167  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0945  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.86 
 
 		 926 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2746  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 596 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.313231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2140  fused multi-sensor protein  27.93 
 
 		 882 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.236911  normal  0.359885 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 		 833 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0909  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  49.13 
 
 		 781 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.015368  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 975 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.39 
 
 		 1548 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 		 896 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.27 
 
 		 974 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 764 aa  164  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  30.54 
 
 		 853 aa  163  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3680  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.81 
 
 		 744 aa  163  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 573 aa  163  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.52 
 
 		 738 aa  163  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 		 882 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.19 
 
 		 815 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  34.62 
 
 		 603 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 661 aa  162  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 		 919 aa  162  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.42 
 
 		 524 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 		 1069 aa  162  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 		 1237 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 581 aa  161  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00493244  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3308  sensor histidine kinase  38.71 
 
 		 845 aa  161  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 1022 aa  161  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 1354 aa  161  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 		 680 aa  161  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 490 aa  161  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 1145 aa  160  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 973 aa  160  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 782 aa  160  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 		 1271 aa  160  8e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 926 aa  160  9e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 1075 aa  160  9e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2216  sensory box protein  34.85 
 
 		 752 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1369  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 767 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0713189  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  37.6 
 
 		 565 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 970 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  38.33 
 
 		 576 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 		 1161 aa  159  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2127  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 		 815 aa  159  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 		 1223 aa  159  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.97 
 
 		 1260 aa  158  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 		 866 aa  158  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 444 aa  157  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 		 911 aa  157  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 		 1398 aa  158  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  30.63 
 
 		 1026 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 		 1116 aa  157  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0211  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 671 aa  157  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.143322 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2655  histidine kinase  40.08 
 
 		 433 aa  157  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.306578  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.31 
 
 		 1203 aa  157  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2206  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.73 
 
 		 752 aa  157  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 		 713 aa  156  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.98 
 
 		 853 aa  156  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 		 781 aa  156  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 		 827 aa  156  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 		 1165 aa  156  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.04 
 
 		 868 aa  156  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1083  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.83 
 
 		 887 aa  156  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.240403  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3431  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 		 756 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>