More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0389 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0389  histidine kinase  100 
 
 		 557 aa  1115    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 725 aa  232  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.302229  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 		 521 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.41 
 
 		 553 aa  187  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 		 520 aa  186  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 		 479 aa  185  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0408317  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.73 
 
 		 762 aa  183  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15596  normal  0.128973 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.07 
 
 		 656 aa  183  8.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2154  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.97 
 
 		 572 aa  182  9.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.32555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1796  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.4 
 
 		 756 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.232536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1956  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.49 
 
 		 748 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727974  normal  0.121547 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2444  sensor histidine kinase  38.67 
 
 		 610 aa  177  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.119384  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 		 941 aa  176  9e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109629  normal  0.20707 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2356  phytochrome family protein, putative  42.06 
 
 		 755 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 616 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.459436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 748 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 604 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2793  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 763 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal  0.714834 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3141  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 762 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583701  normal  0.345899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0539  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 		 751 aa  170  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.802089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4270  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 		 751 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.235212 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  39.74 
 
 		 583 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2667  sensory box histidine kinase  39.74 
 
 		 498 aa  167  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5134  histidine kinase  37.55 
 
 		 431 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5638  histidine kinase  40.59 
 
 		 540 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  40.09 
 
 		 604 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 591 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 1166 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 536 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 		 458 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 		 1003 aa  164  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3432  histidine kinase  41.48 
 
 		 796 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1292  histidine kinase  37.34 
 
 		 498 aa  162  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.0780099999999995e-22 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 618 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0255  sensory box histidine kinase  39.48 
 
 		 616 aa  160  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  41.3 
 
 		 794 aa  160  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 1166 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2762  histidine kinase  41.81 
 
 		 558 aa  160  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 791 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3435  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 605 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.188279 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  34.83 
 
 		 492 aa  158  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 857 aa  157  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 396 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04304  two-component system sensor protein  35.55 
 
 		 603 aa  157  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  34.29 
 
 		 749 aa  156  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 386 aa  156  8e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1050  sensory box histidine kinase  39.27 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2770  histidine kinase  40.62 
 
 		 418 aa  156  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 714 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.523166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 		 604 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 738 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1286  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 859 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  35.79 
 
 		 533 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 517 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1827  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 493 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2186  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 381 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000654459  hitchhiker  0.000162526 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 556 aa  152  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 502 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0822  sensory box histidine kinase  35.44 
 
 		 729 aa  151  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  38.13 
 
 		 499 aa  150  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1826  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 363 aa  150  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1756  PAS sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 718 aa  150  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.977279  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2153  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 645 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2669  sensor histidine kinase  37.61 
 
 		 343 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1145  multi-sensor signal transduction multi-kinase  38.31 
 
 		 532 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2088  histidine kinase  37.5 
 
 		 282 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.409720000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3141  histidine kinase  36.32 
 
 		 307 aa  148  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 355 aa  148  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1121  histidine kinase  36.75 
 
 		 307 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 483 aa  147  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0103  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 639 aa  147  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2790  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 463 aa  147  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 		 1177 aa  147  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1036  sensor histidine kinase  36.91 
 
 		 579 aa  146  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.696907  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2086  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 798 aa  146  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0947899999999999e-22 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 396 aa  146  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2168  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 711 aa  146  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 915 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 1562 aa  146  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2565  sensor histidine kinase  38.18 
 
 		 255 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 591 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 		 521 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0541  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 587 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000947824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  37.99 
 
 		 770 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 517 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1814  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 566 aa  145  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267062 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2049  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 711 aa  144  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 1224 aa  144  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 		 807 aa  144  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.309689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  36.06 
 
 		 496 aa  143  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4824  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 431 aa  143  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2402  ATP-binding region, ATPase-like  36.93 
 
 		 762 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0299776 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 810 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0852026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 779 aa  143  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0475  sensory box histidine kinase  36.75 
 
 		 622 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1670  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 394 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261958  normal  0.184327 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 729 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4048  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 431 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2070  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 645 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000789609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>