More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0597 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
509 aa  1019    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.490677  normal  0.372595 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
798 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 
1192 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1447  histidine kinase A-like  29.04 
 
 
1201 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
617 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
770 aa  119  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
600 aa  119  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1012  Signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 
1005 aa  118  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.948548  normal  0.15115 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 
836 aa  118  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
778 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
1031 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244216  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 
769 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3923  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
1055 aa  116  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
717 aa  116  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1469  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 
1149 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  29.23 
 
 
1035 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1549  sensory box histidine kinase  28.52 
 
 
1035 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 
969 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299525  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4618  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 
1191 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 
1138 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
844 aa  114  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
1000 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420098  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 
830 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0705844  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
468 aa  113  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 
1276 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
830 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.919247  hitchhiker  0.00131243 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0680  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 
728 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  25.93 
 
 
1410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 
861 aa  111  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.235165  normal  0.571653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 
1296 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
389 aa  110  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 
1188 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478025  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 
769 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
774 aa  110  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 
530 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
533 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  29.26 
 
 
783 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
772 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 
523 aa  109  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  29.26 
 
 
783 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 
371 aa  108  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  26.28 
 
 
576 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
784 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 
582 aa  107  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
562 aa  107  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  28.2 
 
 
532 aa  107  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 
530 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 
536 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  28.74 
 
 
773 aa  106  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 
531 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 
536 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
911 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
502 aa  105  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1284  sensor histidine kinase  29.73 
 
 
475 aa  104  4e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 
456 aa  104  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
981 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0915227  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 
512 aa  103  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  27.72 
 
 
513 aa  103  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
587 aa  103  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 
513 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 
773 aa  103  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  29.85 
 
 
513 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
511 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  29.85 
 
 
513 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1944  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 
607 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  31.98 
 
 
511 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3481  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
704 aa  101  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.112139 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  24.81 
 
 
790 aa  101  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  27.68 
 
 
511 aa  101  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
377 aa  101  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 
594 aa  100  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 
785 aa  100  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 
518 aa  100  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
511 aa  100  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  29.76 
 
 
470 aa  100  8e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  27.08 
 
 
603 aa  99.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 
513 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1586  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
442 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1775  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.24 
 
 
510 aa  99.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1611  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
442 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 
524 aa  99.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
857 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485802  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
511 aa  99  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4432  ATPase domain-containing protein  29.28 
 
 
846 aa  99  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.645763 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4896  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 
842 aa  99  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 
795 aa  99  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 
1022 aa  97.4  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
764 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
620 aa  97.1  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.72 
 
 
1287 aa  97.1  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
509 aa  96.7  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1778  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
606 aa  97.1  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415214  decreased coverage  0.0072817 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  29.13 
 
 
470 aa  95.9  1e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 
605 aa  96.3  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  26.56 
 
 
503 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2063  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
610 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.57 
 
 
700 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.83 
 
 
1352 aa  96.3  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
782 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
614 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>