More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1427 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 717 aa  1450    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  50.56 
 
 		 1018 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  50.42 
 
 		 1322 aa  472  1.0000000000000001e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  53.13 
 
 		 1016 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  51.63 
 
 		 1209 aa  461  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  51.4 
 
 		 1262 aa  457  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  49.46 
 
 		 1264 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354443 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0766  ammonium transporter  44.14 
 
 		 644 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2151  ammonium transporter  39.65 
 
 		 611 aa  374  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2156  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  44.23 
 
 		 904 aa  363  6e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.145891  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  46.13 
 
 		 444 aa  348  3e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  47.69 
 
 		 461 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  46.73 
 
 		 468 aa  332  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  46.81 
 
 		 446 aa  330  4e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  45.84 
 
 		 478 aa  330  6e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  45.97 
 
 		 458 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  45.72 
 
 		 478 aa  329  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  45.12 
 
 		 460 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  44.85 
 
 		 449 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  47.89 
 
 		 437 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  46.34 
 
 		 471 aa  314  3.9999999999999997e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0210  ammonium transporter  45.86 
 
 		 439 aa  312  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  42.93 
 
 		 497 aa  311  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0663  ammonium transporter  44.39 
 
 		 407 aa  310  9e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  46.4 
 
 		 483 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  44.36 
 
 		 408 aa  306  8.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  42.89 
 
 		 525 aa  306  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  46.52 
 
 		 441 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  39.64 
 
 		 445 aa  302  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  42.02 
 
 		 506 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  44.47 
 
 		 515 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  44.47 
 
 		 515 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  44.95 
 
 		 435 aa  293  6e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  44.95 
 
 		 435 aa  293  6e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  42.17 
 
 		 511 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  40.35 
 
 		 518 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  41.3 
 
 		 441 aa  285  2.0000000000000002e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  44.1 
 
 		 461 aa  281  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  43.39 
 
 		 509 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  41.46 
 
 		 441 aa  280  5e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  43.71 
 
 		 507 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  41.34 
 
 		 476 aa  278  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  43.71 
 
 		 506 aa  278  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  39.36 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  41.4 
 
 		 482 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  43.09 
 
 		 507 aa  272  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  40.19 
 
 		 584 aa  269  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  41.06 
 
 		 496 aa  269  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  38.97 
 
 		 469 aa  270  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  41.06 
 
 		 496 aa  269  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  41.19 
 
 		 486 aa  269  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02861  ammonium transporter  40.71 
 
 		 486 aa  268  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02851  ammonium transporter  40.71 
 
 		 486 aa  267  5e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.64492  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  40.38 
 
 		 490 aa  266  1e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  40.95 
 
 		 462 aa  266  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  42.44 
 
 		 441 aa  263  6.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0293  Rh family protein/ammonium transporter  40.81 
 
 		 449 aa  263  8.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.825675  normal  0.151871 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  54.1 
 
 		 778 aa  262  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0565  ammonium transporter  44.03 
 
 		 422 aa  261  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000904674  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  41.77 
 
 		 488 aa  261  4e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4745  ammonium transporter  37.69 
 
 		 514 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955224 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.72 
 
 		 523 aa  260  6e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0276  ammonium transporter  40.19 
 
 		 489 aa  260  8e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4446  ammonium transporter  38.76 
 
 		 541 aa  259  8e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.88 
 
 		 617 aa  259  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0265  ammonium transporter  40 
 
 		 487 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4247  ammonium transporter  36.88 
 
 		 495 aa  257  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0572561  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3571  ammonium transporter  40.35 
 
 		 446 aa  256  8e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  42.58 
 
 		 442 aa  254  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000498095  unclonable  0.00000143333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1303  ammonium transporter  41.67 
 
 		 447 aa  254  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.863538  normal  0.392639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6567  ammonium transporter  39.85 
 
 		 474 aa  251  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1530  ammonium transporter  39.49 
 
 		 512 aa  251  4e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  42.58 
 
 		 442 aa  250  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0144  ammonium transporter  40.28 
 
 		 437 aa  248  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2954  ammonium transporter  41.01 
 
 		 488 aa  247  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2018  ammonium transporter  40.58 
 
 		 478 aa  247  6.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.678584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2248  ammonium transporter  40.87 
 
 		 433 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.22 
 
 		 798 aa  240  6.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0643  Rh-like protein/ammonium transporter  37.1 
 
 		 391 aa  239  1e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.32832  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4057  ammonium transporter  41.26 
 
 		 435 aa  239  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.211238 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  36.56 
 
 		 414 aa  239  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2630  ammonium transporter  41.81 
 
 		 440 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1639  ammonium transporter  40.14 
 
 		 489 aa  235  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294546  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28535  Amt family transporter: ammonium  35.55 
 
 		 433 aa  234  3e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.41 
 
 		 505 aa  233  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0079  ammonium transporter  38.01 
 
 		 416 aa  233  8.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.376757  normal  0.798164 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.61 
 
 		 1192 aa  233  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  39.61 
 
 		 416 aa  232  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54981  predicted protein  37.89 
 
 		 539 aa  232  2e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  39.29 
 
 		 421 aa  232  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.81 
 
 		 531 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  47.35 
 
 		 511 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.35 
 
 		 511 aa  231  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3649  ammonium transporter  38.08 
 
 		 416 aa  231  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243704  hitchhiker  0.000385246 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0798  ammonium transporter  38.08 
 
 		 416 aa  231  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0469975  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  48.61 
 
 		 532 aa  231  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3599  ammonium transporter  36.95 
 
 		 417 aa  231  5e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3707  ammonium transporter  38.08 
 
 		 416 aa  231  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00259002  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0680  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.8 
 
 		 728 aa  230  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  44.57 
 
 		 1035 aa  230  8e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>