More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3481 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3481  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
704 aa  1423    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.112139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.46 
 
 
523 aa  247  4.9999999999999997e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  42.21 
 
 
513 aa  226  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  48.35 
 
 
778 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.29 
 
 
617 aa  222  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
512 aa  219  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.67 
 
 
798 aa  218  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  37.01 
 
 
511 aa  213  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 
511 aa  211  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  40.96 
 
 
511 aa  210  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 
511 aa  210  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 
513 aa  207  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  38.25 
 
 
513 aa  206  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  38.25 
 
 
513 aa  206  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 
530 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 
770 aa  206  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  42.66 
 
 
532 aa  206  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.61 
 
 
533 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.98 
 
 
1192 aa  205  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 
717 aa  205  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 
531 aa  205  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3923  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 
1055 aa  204  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  42.49 
 
 
536 aa  204  5e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.03 
 
 
530 aa  204  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  43.31 
 
 
1035 aa  203  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.5 
 
 
774 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1549  sensory box histidine kinase  43.31 
 
 
1035 aa  203  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
536 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 
511 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.93 
 
 
600 aa  201  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.28 
 
 
1138 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 
505 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  46.77 
 
 
288 aa  199  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.8 
 
 
844 aa  196  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 
594 aa  196  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  44.8 
 
 
773 aa  196  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
377 aa  196  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.8 
 
 
518 aa  196  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 
911 aa  196  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  45.92 
 
 
771 aa  195  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 
502 aa  194  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 
782 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 
513 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 
1296 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 
1276 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 
1000 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420098  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.02 
 
 
969 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299525  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 
620 aa  191  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
784 aa  191  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.16 
 
 
775 aa  191  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  44.59 
 
 
790 aa  191  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  41.67 
 
 
773 aa  191  5e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  42.51 
 
 
1410 aa  191  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 
769 aa  188  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.09 
 
 
764 aa  188  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  43.95 
 
 
771 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  40.65 
 
 
470 aa  187  5e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 
769 aa  187  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 
389 aa  186  9e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
779 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  41.01 
 
 
774 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  41.42 
 
 
783 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.29 
 
 
754 aa  186  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  41.42 
 
 
783 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 
772 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  41.45 
 
 
503 aa  185  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 
1352 aa  185  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
836 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.49 
 
 
509 aa  183  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.98 
 
 
484 aa  182  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 
775 aa  182  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 
456 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.83 
 
 
786 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.87 
 
 
587 aa  180  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 
1274 aa  180  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 
763 aa  180  7e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0877  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 
548 aa  180  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.991624  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  39.84 
 
 
470 aa  180  9e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2901  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.87 
 
 
733 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.248575  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  44.44 
 
 
1046 aa  178  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
769 aa  178  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  41.7 
 
 
508 aa  177  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.26 
 
 
786 aa  177  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1168  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 
676 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.85 
 
 
643 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  43.88 
 
 
605 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1944  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 
607 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  43.85 
 
 
648 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0543  PAS sensor protein  44.4 
 
 
786 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0831512  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  43.11 
 
 
525 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 
795 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228463 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 
562 aa  174  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  35.29 
 
 
565 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.24 
 
 
687 aa  174  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 
646 aa  174  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 
627 aa  173  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 
614 aa  173  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
646 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1779  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44 
 
 
612 aa  173  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.0258189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>