More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1249 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.17 
 
 
981 aa  643    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0915227  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1012  Signal transduction histidine kinase  68.29 
 
 
1005 aa  1352    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.948548  normal  0.15115 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1469  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.13 
 
 
1149 aa  858    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  61.01 
 
 
1188 aa  880    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478025  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1447  histidine kinase A-like  58.14 
 
 
1201 aa  853    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1031 aa  2060    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244216  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4618  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.94 
 
 
1191 aa  827    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3923  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.3 
 
 
1055 aa  482  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
1276 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
1138 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  44.38 
 
 
1035 aa  403  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1549  sensory box histidine kinase  44.18 
 
 
1035 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.52 
 
 
1192 aa  399  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  40.03 
 
 
1410 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.5 
 
 
1296 aa  366  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
836 aa  366  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 
969 aa  361  4e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 
1000 aa  347  5e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420098  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0680  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.17 
 
 
728 aa  343  7e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2784  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
841 aa  273  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.759601  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2561  PAS sensor protein  38.19 
 
 
846 aa  266  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218837  normal  0.950665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
853 aa  249  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
846 aa  196  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0595123  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
911 aa  170  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
513 aa  165  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
717 aa  164  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
511 aa  164  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  37.07 
 
 
513 aa  163  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  37.07 
 
 
513 aa  163  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
798 aa  162  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  35.91 
 
 
513 aa  160  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
511 aa  160  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
513 aa  159  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  34.41 
 
 
503 aa  159  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
697 aa  158  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
512 aa  159  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  29.73 
 
 
773 aa  158  5.0000000000000005e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  27.5 
 
 
1255 aa  157  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
530 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 
518 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  35.02 
 
 
511 aa  155  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
594 aa  154  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
844 aa  154  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
523 aa  154  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
536 aa  154  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  36.76 
 
 
532 aa  154  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 
1069 aa  153  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
533 aa  152  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 
1369 aa  152  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
778 aa  151  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 
1041 aa  150  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.73134 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
536 aa  150  9e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  34.24 
 
 
511 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
773 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  27.59 
 
 
790 aa  150  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
511 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
371 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
530 aa  150  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
468 aa  149  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
531 aa  149  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
882 aa  148  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
785 aa  146  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.76 
 
 
940 aa  145  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
484 aa  145  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
784 aa  144  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
770 aa  145  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  33.47 
 
 
774 aa  144  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  26.21 
 
 
823 aa  144  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.08 
 
 
881 aa  144  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
764 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  31.87 
 
 
470 aa  144  9.999999999999999e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
583 aa  143  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
484 aa  143  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
661 aa  142  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
769 aa  142  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
774 aa  142  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3680  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 
744 aa  142  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614037  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
509 aa  141  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
389 aa  141  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 
769 aa  141  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 
769 aa  141  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  30.74 
 
 
783 aa  140  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  30.74 
 
 
783 aa  140  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 
866 aa  140  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
617 aa  140  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.61 
 
 
1548 aa  140  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
620 aa  139  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  31.01 
 
 
470 aa  139  2e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  29.67 
 
 
599 aa  140  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  30.3 
 
 
771 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
775 aa  140  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.35 
 
 
1433 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
377 aa  139  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 
772 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
587 aa  139  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
614 aa  139  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 
786 aa  138  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
775 aa  138  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  31.36 
 
 
525 aa  138  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  30.2 
 
 
288 aa  137  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>