More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2623 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  68.07 
 
 		 587 aa  773    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  84.39 
 
 		 605 aa  960    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  69.32 
 
 		 627 aa  795    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1779  multi-sensor signal transduction histidine kinase  72.12 
 
 		 612 aa  829    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1944  multi-sensor signal transduction histidine kinase  69.92 
 
 		 607 aa  804    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 614 aa  1239    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2063  multi-sensor signal transduction histidine kinase  69.97 
 
 		 610 aa  800    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 		 643 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  42.81 
 
 		 648 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 		 646 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.49 
 
 		 605 aa  395  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0997338  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1778  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 606 aa  395  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415214  decreased coverage  0.0072817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.02 
 
 		 630 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.591777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.7 
 
 		 494 aa  300  6e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 583 aa  289  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.75 
 
 		 484 aa  253  8.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  34.87 
 
 		 599 aa  252  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  43.84 
 
 		 525 aa  252  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 513 aa  248  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  38.77 
 
 		 503 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0577  sensor histidine kinase  36.31 
 
 		 609 aa  233  6e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.704828  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0577  sensor histidine kinase  34.84 
 
 		 609 aa  233  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 614 aa  231  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 661 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.75 
 
 		 1350 aa  217  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.14 
 
 		 1596 aa  216  9e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 		 911 aa  216  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 579 aa  212  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 		 389 aa  209  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 713 aa  208  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 523 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0877  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 548 aa  207  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.991624  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 		 562 aa  207  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 456 aa  207  7e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.84 
 
 		 774 aa  205  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3595  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 		 744 aa  205  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 617 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 		 973 aa  201  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 844 aa  201  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 798 aa  200  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 		 717 aa  199  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  35.09 
 
 		 1255 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 568 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  44.18 
 
 		 774 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  45.19 
 
 		 565 aa  198  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 1303 aa  197  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 		 969 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 		 502 aa  197  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  33.62 
 
 		 773 aa  196  9e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0210  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.12 
 
 		 708 aa  196  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  42.8 
 
 		 771 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  40.5 
 
 		 511 aa  195  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 769 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.68 
 
 		 770 aa  194  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  44.16 
 
 		 783 aa  194  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 		 371 aa  194  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  44.16 
 
 		 783 aa  194  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 		 784 aa  194  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  41.58 
 
 		 576 aa  194  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 778 aa  194  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 775 aa  194  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44 
 
 		 594 aa  193  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  44.18 
 
 		 620 aa  193  8e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 763 aa  192  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.18 
 
 		 518 aa  192  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 		 505 aa  192  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  42.16 
 
 		 513 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  42.16 
 
 		 513 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 533 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03428  PAS signal transduction protein  33.5 
 
 		 962 aa  191  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 927 aa  190  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 		 513 aa  190  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  44.59 
 
 		 771 aa  190  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 		 775 aa  190  8e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.46 
 
 		 646 aa  189  9e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 		 511 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  39.86 
 
 		 511 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 1192 aa  189  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 		 377 aa  189  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 		 536 aa  187  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 		 531 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 		 676 aa  187  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0996  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 		 832 aa  186  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 		 600 aa  186  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 		 984 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  41.22 
 
 		 532 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 		 836 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 		 1622 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 		 512 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.69 
 
 		 1126 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 		 779 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  38.77 
 
 		 461 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 		 530 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  41.77 
 
 		 790 aa  184  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2648  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 		 997 aa  184  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 		 769 aa  184  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 		 977 aa  184  6e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 582 aa  184  6e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.91 
 
 		 1611 aa  184  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>