More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4663 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  63.77 
 
 
646 aa  770    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  64.2 
 
 
648 aa  769    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  64.17 
 
 
643 aa  775    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
630 aa  1228    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.591777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  58.21 
 
 
605 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0997338  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1778  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.64 
 
 
606 aa  571  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415214  decreased coverage  0.0072817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.17 
 
 
627 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.14 
 
 
587 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2063  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 
610 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1944  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.28 
 
 
607 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.58 
 
 
614 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 
605 aa  371  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1779  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.66 
 
 
612 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.89 
 
 
494 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 
583 aa  306  9.000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 
614 aa  244  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0577  sensor histidine kinase  39.1 
 
 
609 aa  242  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.94 
 
 
513 aa  242  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0577  sensor histidine kinase  38.89 
 
 
609 aa  239  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.704828  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  41.74 
 
 
503 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  43.24 
 
 
525 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0877  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 
548 aa  232  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.991624  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 
484 aa  227  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  40 
 
 
599 aa  224  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
661 aa  219  8.999999999999998e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 
617 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.12 
 
 
1352 aa  205  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.75 
 
 
717 aa  201  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  42.8 
 
 
771 aa  200  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  43.08 
 
 
783 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 
774 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.88 
 
 
505 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  43.08 
 
 
783 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.66 
 
 
600 aa  199  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
778 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 
562 aa  197  4.0000000000000005e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 
579 aa  197  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  39.76 
 
 
470 aa  196  9e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  41.29 
 
 
771 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 
769 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.63 
 
 
782 aa  196  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 
911 aa  196  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  41.98 
 
 
774 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 
772 aa  195  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  46.37 
 
 
508 aa  194  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 
775 aa  194  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 
784 aa  193  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 
798 aa  192  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 
779 aa  191  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 
770 aa  190  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.77 
 
 
1363 aa  188  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 
769 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 
775 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  42.23 
 
 
790 aa  186  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  39.52 
 
 
773 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
456 aa  185  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 
769 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.59 
 
 
764 aa  184  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 
1138 aa  183  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.45 
 
 
1285 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 
844 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  40.73 
 
 
288 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  39.25 
 
 
513 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 
767 aa  183  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 
513 aa  182  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 
511 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  39.1 
 
 
511 aa  180  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  41.77 
 
 
513 aa  180  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  41.77 
 
 
513 aa  180  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 
969 aa  179  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 
468 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 
512 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.58 
 
 
862 aa  179  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  39.68 
 
 
1046 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  42.28 
 
 
511 aa  179  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 
713 aa  179  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  37.85 
 
 
470 aa  178  2e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 
511 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  40.23 
 
 
970 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 
1276 aa  178  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  39.29 
 
 
532 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
371 aa  177  8e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 
795 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 
1296 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
533 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 
1322 aa  176  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 
530 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 
536 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 
676 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 
531 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
530 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_002978  WD1284  sensor histidine kinase  35.97 
 
 
475 aa  172  1e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3167  signal transduction histidine kinase-like protein  33.49 
 
 
1077 aa  173  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0540842 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
536 aa  173  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
582 aa  172  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  29.77 
 
 
729 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 
973 aa  172  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  37.93 
 
 
1410 aa  172  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 
518 aa  172  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
490 aa  172  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>