More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3923 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 
1138 aa  824    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  80.83 
 
 
1035 aa  1690    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1549  sensory box histidine kinase  80.83 
 
 
1035 aa  1688    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3923  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1055 aa  2122    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.79 
 
 
1296 aa  721    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.28 
 
 
1276 aa  727    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  62.48 
 
 
1192 aa  632  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  52.98 
 
 
1410 aa  566  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
1031 aa  480  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244216  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1012  Signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
1005 aa  478  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.948548  normal  0.15115 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
1188 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478025  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1469  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 
1149 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.03 
 
 
836 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0680  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.9 
 
 
728 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.25 
 
 
969 aa  412  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 
1000 aa  396  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420098  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 
981 aa  361  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0915227  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2561  PAS sensor protein  34.93 
 
 
846 aa  254  9.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218837  normal  0.950665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2784  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
841 aa  253  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.759601  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
853 aa  239  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 
717 aa  226  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 
523 aa  220  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 
377 aa  211  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
844 aa  211  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 
798 aa  209  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 
389 aa  206  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
911 aa  204  7e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
773 aa  202  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
778 aa  202  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 
518 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  40.96 
 
 
511 aa  200  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  32.29 
 
 
823 aa  200  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  40.94 
 
 
470 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
617 aa  199  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
846 aa  199  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0595123  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5383  Signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
784 aa  198  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626951  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3481  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 
704 aa  196  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.112139 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  37.91 
 
 
773 aa  196  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  40.55 
 
 
470 aa  196  2e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  34.44 
 
 
779 aa  195  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 
620 aa  195  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
456 aa  195  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 
511 aa  194  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  38.72 
 
 
288 aa  194  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 
511 aa  194  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  39.78 
 
 
532 aa  194  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  41.77 
 
 
511 aa  194  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
468 aa  194  8e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 
533 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 
511 aa  191  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  32.11 
 
 
503 aa  191  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 
769 aa  191  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  32.27 
 
 
1046 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 
531 aa  191  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
1548 aa  191  8e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
513 aa  191  9e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 
530 aa  191  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  38.2 
 
 
513 aa  190  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 
530 aa  190  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 
784 aa  190  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
512 aa  189  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  38.87 
 
 
513 aa  189  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  38.87 
 
 
513 aa  189  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 
697 aa  188  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  29.04 
 
 
771 aa  187  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 
594 aa  187  9e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 
587 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 
536 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 
600 aa  187  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
1041 aa  186  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.73134 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  32.9 
 
 
746 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 
536 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 
513 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 
775 aa  185  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
774 aa  185  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  31.2 
 
 
576 aa  184  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
763 aa  184  6e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 
484 aa  184  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  31.68 
 
 
774 aa  184  9.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  41.5 
 
 
508 aa  183  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  30.53 
 
 
771 aa  184  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  30.13 
 
 
1255 aa  183  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4184  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 
783 aa  182  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  38.63 
 
 
790 aa  182  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  40.33 
 
 
783 aa  182  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  40.33 
 
 
783 aa  182  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 
502 aa  181  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
505 aa  181  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 
770 aa  181  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 
769 aa  180  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 
882 aa  180  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 
614 aa  180  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 
769 aa  180  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 
866 aa  180  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  35.85 
 
 
599 aa  179  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0877  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
548 aa  179  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.991624  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 
1068 aa  178  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 
583 aa  178  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3167  signal transduction histidine kinase-like protein  31.59 
 
 
1077 aa  177  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0540842 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 
775 aa  177  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>