More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5029 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 498 aa  974    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.988505  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4645  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 644 aa  214  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4217  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 		 686 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34172  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4367  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 		 800 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.522603  normal  0.113968 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4373  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.96 
 
 		 687 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0865062  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4350  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 686 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5165  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 		 593 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.95 
 
 		 1465 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5807  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.32 
 
 		 990 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 1021 aa  121  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1908  histidine kinase  29.97 
 
 		 772 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0199543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1037  histidine kinase  31.1 
 
 		 608 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 678 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  26.37 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.73 
 
 		 695 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4039  histidine kinase  31.27 
 
 		 572 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 		 402 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3526  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 584 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2543  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.52 
 
 		 823 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.906632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2111  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 682 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4130  histidine kinase  29.24 
 
 		 572 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.964997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3228  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 609 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.88 
 
 		 1146 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.18 
 
 		 683 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.38 
 
 		 844 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2923  histidine kinase  31.27 
 
 		 598 aa  106  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1676  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.06 
 
 		 850 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109527  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  32.38 
 
 		 596 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1970  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.89 
 
 		 602 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.316288  normal  0.365319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.1 
 
 		 688 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.94 
 
 		 713 aa  105  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1802  histidine kinase  31.03 
 
 		 540 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.963501  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1728  histidine kinase  31.03 
 
 		 560 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.79 
 
 		 842 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1953  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 		 458 aa  103  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0658  sensor histide kinase  26.35 
 
 		 315 aa  103  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1774  histidine kinase  32.03 
 
 		 578 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2200  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.68 
 
 		 848 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00863508  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3516  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.39 
 
 		 614 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.166046 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2145  sensor histidine kinase  25.7 
 
 		 311 aa  102  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1302  histidine kinase  30.69 
 
 		 596 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000333005 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2797  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 480 aa  101  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.32 
 
 		 850 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346291  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  24.82 
 
 		 557 aa  101  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 604 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 683 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1854  histidine kinase  31.41 
 
 		 578 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2175  histidine kinase  32.08 
 
 		 599 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3910  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.3 
 
 		 850 aa  99.8  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.302032  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  25.27 
 
 		 1187 aa  99.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2102  histidine kinase  31.05 
 
 		 575 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.25 
 
 		 553 aa  99.4  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2081  histidine kinase  32.08 
 
 		 597 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 392 aa  99.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 584 aa  99.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  26.68 
 
 		 611 aa  98.6  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  28.65 
 
 		 617 aa  99  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1535  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.86 
 
 		 566 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2755  periplasmic substrate-binding protein/sensor histidine kinase  31.42 
 
 		 590 aa  98.2  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5455  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 571 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0104043  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1855  histidine kinase  35.79 
 
 		 600 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.355606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.33 
 
 		 679 aa  98.6  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  26.6 
 
 		 305 aa  97.8  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5744  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.43 
 
 		 510 aa  97.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.739341 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  25.27 
 
 		 310 aa  97.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.87 
 
 		 1262 aa  97.4  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3803  histone-like DNA-binding protein  23.83 
 
 		 308 aa  97.1  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  26.74 
 
 		 408 aa  96.3  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2725  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 		 834 aa  96.3  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0569323  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  25.68 
 
 		 608 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  26.74 
 
 		 408 aa  96.3  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 588 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0126  sensor histidine kinase  28.62 
 
 		 708 aa  96.3  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000118135  normal  0.929624 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 536 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000503711  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  25.08 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.76 
 
 		 652 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1533  histidine kinase  24.11 
 
 		 497 aa  95.5  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3096  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 659 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 492 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 707 aa  95.1  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000535893  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0246  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 573 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0266042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  25.68 
 
 		 608 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.68 
 
 		 608 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  25.68 
 
 		 608 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1172  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 		 450 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  25.68 
 
 		 608 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03784  sensor histidine kinase  25.74 
 
 		 501 aa  94.4  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  25.68 
 
 		 608 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.79 
 
 		 801 aa  94.7  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 717 aa  94  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273141  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 690 aa  93.6  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2287  histidine kinase  24.32 
 
 		 770 aa  93.6  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.709847  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02266  hypothetical protein  30.88 
 
 		 680 aa  93.2  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2960  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.18 
 
 		 622 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4673  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 		 713 aa  93.2  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0052  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.39 
 
 		 1054 aa  93.2  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1697  histidine kinase  32.01 
 
 		 505 aa  93.2  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3474  histidine kinase  24.18 
 
 		 449 aa  92.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0952  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.58 
 
 		 445 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0311  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.52 
 
 		 383 aa  92.4  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.138677  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>