More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3628 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 292 aa  599  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  82.68 
 
 		 262 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  71.62 
 
 		 230 aa  338  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.0443917 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.89 
 
 		 262 aa  314  9e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  60.91 
 
 		 259 aa  305  5.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3199  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.39 
 
 		 262 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 231 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3373  two component LuxR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.492418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  31.42 
 
 		 234 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3237  response regulator  33.79 
 
 		 219 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.67 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1651  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.03 
 
 		 218 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  31.72 
 
 		 234 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.95 
 
 		 213 aa  113  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3952  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 222 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.8 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.6 
 
 		 253 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3161  two component response regulator transcription regulator protein  31.86 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4304  response regulator receiver  34.4 
 
 		 216 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.894661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  31.65 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3592  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.27 
 
 		 235 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1255  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 219 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.490147  normal  0.40644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.84 
 
 		 234 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 228 aa  109  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  31.02 
 
 		 215 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 244 aa  109  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.8 
 
 		 218 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 216 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 217 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.03 
 
 		 225 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.02 
 
 		 213 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  32.09 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  32.09 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  32.09 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  32.09 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  32.09 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  31.02 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  31.02 
 
 		 215 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.26 
 
 		 210 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.84 
 
 		 219 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 227 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0939  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 247 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.224899  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0163  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.48 
 
 		 213 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.107009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  36.57 
 
 		 220 aa  106  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 214 aa  106  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.8 
 
 		 220 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.48 
 
 		 222 aa  106  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  29.91 
 
 		 228 aa  106  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  31.63 
 
 		 210 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  30.56 
 
 		 215 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  32.09 
 
 		 210 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  31.98 
 
 		 221 aa  106  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1249  response regulator  30.08 
 
 		 245 aa  106  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0947405  normal  0.0892263 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  32.6 
 
 		 226 aa  106  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  32.09 
 
 		 210 aa  105  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  30.56 
 
 		 215 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  30.56 
 
 		 215 aa  105  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  30.56 
 
 		 215 aa  105  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  30.56 
 
 		 215 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  30.56 
 
 		 215 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 223 aa  105  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  31.63 
 
 		 210 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.68 
 
 		 217 aa  105  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.99 
 
 		 218 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4084  two component LuxR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 246 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.94 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4735  two component LuxR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 209 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545478  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.19 
 
 		 228 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3437  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.83 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.73 
 
 		 225 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  30.73 
 
 		 230 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.4 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.46 
 
 		 224 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 215 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0377  two component LuxR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.03 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0651  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.56 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  31.48 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2836  two component LuxR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 207 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  31.94 
 
 		 213 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3030  two component LuxR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 218 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 232 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.83 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 218 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  29.91 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.57 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.51 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 216 aa  102  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973321  normal  0.0605156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>