More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2543 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  474  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.0443917 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  74.89 
 
 		 262 aa  358  4e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  70.31 
 
 		 259 aa  339  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  71.62 
 
 		 292 aa  338  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  70.26 
 
 		 262 aa  332  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3199  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.08 
 
 		 262 aa  261  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.29 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4084  two component LuxR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0377  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3161  two component response regulator transcription regulator protein  34.55 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.62 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  32.88 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 244 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  33.18 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3373  two component LuxR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.492418  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3592  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.7 
 
 		 235 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.2 
 
 		 213 aa  115  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 214 aa  114  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.73 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3515  two component LuxR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150532  hitchhiker  0.00248481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4304  response regulator receiver  34.42 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.894661  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.08 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1616  response regulator receiver  29.58 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.869432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1651  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0939  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 247 aa  111  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.224899  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 228 aa  111  9e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3952  two component LuxR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  31.22 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3237  response regulator  31.36 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  33.18 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.94 
 
 		 253 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1132  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.71 
 
 		 214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1122  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.41 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.752968  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 		 216 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 257 aa  108  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.3 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.63 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1255  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.57 
 
 		 219 aa  108  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.490147  normal  0.40644 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.94 
 
 		 228 aa  108  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.56 
 
 		 222 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 232 aa  108  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 217 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  30.88 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0347  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.29 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.1 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  31.28 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.11 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  29.82 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.48 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  32.24 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1734  two component LuxR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159279  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.99 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.99 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.1 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.91 
 
 		 225 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.46 
 
 		 214 aa  105  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  31.13 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.05 
 
 		 210 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4735  two component LuxR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545478  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  33.64 
 
 		 218 aa  105  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  30.29 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  30.29 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  30.29 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  30.29 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  30.29 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  30.77 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1985  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.84 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  31.51 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  33.02 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  29.03 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.86 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  30.29 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  29.67 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2445  response regulator receiver protein  32.39 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115114  normal  0.02149 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.48 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.36 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0277195 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.76 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.18 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  29.81 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>