More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0612 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  459  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  62.67 
 
 		 244 aa  265  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  53.98 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3592  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.78 
 
 		 235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1734  two component LuxR family transcriptional regulator  52.23 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159279  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3595  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.43 
 
 		 225 aa  148  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414086  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3161  two component response regulator transcription regulator protein  40.96 
 
 		 231 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4439  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0939  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.224899  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4084  two component LuxR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3373  two component LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.492418  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  35.65 
 
 		 220 aa  115  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3515  two component LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 214 aa  114  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150532  hitchhiker  0.00248481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.65 
 
 		 222 aa  114  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  36.68 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3952  two component LuxR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1549  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.12 
 
 		 238 aa  111  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196807  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3199  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0377  two component LuxR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.4 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3237  response regulator  32.88 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  31.42 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 212 aa  108  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  33.49 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.73 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.0443917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.56 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  32.87 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.48 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.14 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  35.68 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2145  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.92 
 
 		 220 aa  105  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.57 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  34.84 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 228 aa  105  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 237 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 262 aa  105  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.27 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3102  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.12 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.774177  normal  0.15342 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.58 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.44 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1249  response regulator  33.61 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0947405  normal  0.0892263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  32.6 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.08 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.32 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 232 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.94 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.43 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 259 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  33.91 
 
 		 242 aa  102  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  31.09 
 
 		 232 aa  102  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.88 
 
 		 221 aa  102  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1241  two component LuxR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 216 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000399601  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 250 aa  101  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.6 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.53 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0992  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850793  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  36.2 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  32.13 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  30.45 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  31.64 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  31.64 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0209  two component LuxR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 223 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.2 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 292 aa  99.8  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3070  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.72 
 
 		 216 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000689776  unclonable  0.00000000000283062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4096  two component LuxR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 237 aa  99.4  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.811447  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18530  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.36 
 
 		 209 aa  99.4  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 220 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1616  response regulator receiver  31.72 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.869432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 303 aa  99.4  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.76 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  30.41 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1319  two component LuxR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 216 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0542522  decreased coverage  0.000972679 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1285  two component LuxR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 216 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000337392  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 221 aa  99  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  33.18 
 
 		 206 aa  99  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 207 aa  99  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>