More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3515 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3515  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  421  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150532  hitchhiker  0.00248481 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 237 aa  144  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3161  two component response regulator transcription regulator protein  40.74 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4084  two component LuxR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 246 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 229 aa  128  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  38.03 
 
 		 234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3373  two component LuxR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 262 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.492418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  35.89 
 
 		 213 aa  121  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.62 
 
 		 253 aa  121  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0939  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.39 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.224899  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3199  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.33 
 
 		 262 aa  118  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 237 aa  118  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  36.15 
 
 		 234 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3952  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 222 aa  118  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  35.89 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  33.33 
 
 		 213 aa  114  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 231 aa  114  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 207 aa  114  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3237  response regulator  34.4 
 
 		 219 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  33.02 
 
 		 220 aa  114  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.0443917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3621  response regulatory protein  34.17 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0192509  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.13 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3592  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4160  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.15 
 
 		 215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0201669  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0377  two component LuxR family transcriptional regulator  42.94 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3102  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.5 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.774177  normal  0.15342 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  34.12 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1616  response regulator receiver  32.54 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.869432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1249  response regulator  35.25 
 
 		 245 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0947405  normal  0.0892263 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  33.8 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4735  two component LuxR family transcriptional regulator  34 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545478  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.78 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 259 aa  109  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  37.02 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.15 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 215 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.721789  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 303 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2743  two component LuxR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 215 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.1 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2846  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.243379  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2938  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.52 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5375  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.02 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2754  two component LuxR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221671  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.62 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0919  two component LuxR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1446  response regulator receiver protein  33.49 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167897  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.46 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.81 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.97 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.11 
 
 		 219 aa  104  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 215 aa  104  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.87 
 
 		 262 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.97 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  31.13 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1435  two component LuxR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.67 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  32.85 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  30.66 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0303042  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3409  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.2 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306896  hitchhiker  0.000114505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  32.54 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2324  DNA-binding response regulator  28.37 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2145  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.17 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196231  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6596  two component LuxR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 249 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  31.13 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2026  Two-component protein Kinase  29.05 
 
 		 595 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  31.13 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  31.13 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  31.13 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  31.13 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  30.95 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1544  two component LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.1 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.1 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  31.13 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  30.66 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1734  two component LuxR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 257 aa  101  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>