More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0804 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  447  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3373  two component LuxR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.492418  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0939  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.42 
 
 		 247 aa  148  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.224899  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 231 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 244 aa  141  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4084  two component LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 246 aa  138  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0377  two component LuxR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3199  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.99 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3592  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.47 
 
 		 235 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3161  two component response regulator transcription regulator protein  39.73 
 
 		 231 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.0443917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3237  response regulator  36.74 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3515  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150532  hitchhiker  0.00248481 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 259 aa  128  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.82 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3952  two component LuxR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 222 aa  122  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.09 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  35.65 
 
 		 220 aa  115  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.09 
 
 		 217 aa  114  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4160  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.39 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0201669  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 292 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1249  response regulator  35.25 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0947405  normal  0.0892263 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4304  response regulator receiver  34.86 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.894661  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1734  two component LuxR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 257 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159279  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6596  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2836  two component LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.48 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 303 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  36.36 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 222 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  35.05 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.09 
 
 		 218 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3030  two component LuxR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 218 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 212 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 218 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3046  two component LuxR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 218 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.826568  normal  0.671191 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 237 aa  105  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 352 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0445779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.38 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.88 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1549  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.53 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196807  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  36.16 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0094  two component LuxR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.16 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.03 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1766  transcriptional regulator NarL  33.64 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.94 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1616  response regulator receiver  31.16 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.869432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  36.15 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.42 
 
 		 253 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3102  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.21 
 
 		 222 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.774177  normal  0.15342 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  32.88 
 
 		 213 aa  102  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.09 
 
 		 208 aa  101  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000124934  normal  0.0275678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0722  two component transcriptional regulator, LuxR family  33 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.511528  normal  0.608348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.48 
 
 		 209 aa  101  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4735  two component LuxR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545478  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.02 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0945  response regulator receiver  32.68 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  36.57 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 215 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.25 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.65 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.89 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4906  response regulator receiver  38.54 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275081  normal  0.875639 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.81 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  32.69 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>