More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3161 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3161  two component response regulator transcription regulator protein  100 
 
 		 231 aa  457  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4084  two component LuxR family transcriptional regulator  57.66 
 
 		 246 aa  257  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0377  two component LuxR family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0939  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.05 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.224899  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3373  two component LuxR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 262 aa  162  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.492418  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3515  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150532  hitchhiker  0.00248481 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 231 aa  131  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 229 aa  131  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4160  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0201669  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3199  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.67 
 
 		 262 aa  125  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 231 aa  125  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 219 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3237  response regulator  35.84 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.0443917 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3952  two component LuxR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.73 
 
 		 233 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0277195 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1249  response regulator  37.57 
 
 		 245 aa  118  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0947405  normal  0.0892263 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.94 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 238 aa  115  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  31.73 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  31.73 
 
 		 215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  31.19 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  31.73 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3621  response regulatory protein  33.33 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0192509  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  31.19 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  31.19 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  31.19 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  31.19 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  31.19 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  34.12 
 
 		 234 aa  112  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3592  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.53 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 215 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 222 aa  111  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.57 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 292 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3102  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.42 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.774177  normal  0.15342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  28.63 
 
 		 597 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4735  two component LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545478  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  32.89 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 213 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1634  two component LuxR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 236 aa  108  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0598487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  33.65 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 209 aa  108  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 253 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1734  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159279  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.46 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0029  two component LuxR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268532  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  32.85 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  35.05 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2754  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221671  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.62 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.18 
 
 		 216 aa  106  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.17 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  32.13 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2743  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8799  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2938  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.55 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2846  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.55 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.243379  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 216 aa  105  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6596  two component LuxR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.78 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  35.02 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.63 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  31.65 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.13 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3494  two component LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.75 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.02 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  33.64 
 
 		 200 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4502  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.65 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  31.19 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  31.39 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  33.64 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.09 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  32.13 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.72 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  33.64 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4672  response regulator receiver protein  31.96 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223352  normal  0.339353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>