More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1634 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1634  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0598487 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3952  two component LuxR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3237  response regulator  43.29 
 
 		 219 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1249  response regulator  38.02 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0947405  normal  0.0892263 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1923  two component LuxR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.177648 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4084  two component LuxR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 246 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3161  two component response regulator transcription regulator protein  34.39 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.67 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 229 aa  98.2  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  30.43 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.91 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.6 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 262 aa  97.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.4 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3102  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.24 
 
 		 222 aa  95.5  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.774177  normal  0.15342 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 244 aa  95.1  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3592  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.77 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.88 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.0443917 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3373  two component LuxR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.492418  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 303 aa  93.6  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 225 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0939  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.9 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.224899  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.4 
 
 		 224 aa  93.6  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.92 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 292 aa  93.2  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 		 209 aa  92.4  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  29.33 
 
 		 222 aa  91.7  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  33.65 
 
 		 207 aa  92  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 213 aa  91.7  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 220 aa  91.7  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 237 aa  91.7  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2525  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.81 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.84 
 
 		 211 aa  91.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.76 
 
 		 215 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.32 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.95 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0377  two component LuxR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.95 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0541  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.49 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  29.1 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.19 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.51 
 
 		 225 aa  89.4  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4160  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.46 
 
 		 215 aa  89.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0201669  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8799  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 227 aa  89  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2846  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.31 
 
 		 215 aa  89  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.243379  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2938  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.31 
 
 		 215 aa  89  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2754  two component LuxR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 215 aa  89  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221671  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.85 
 
 		 222 aa  89  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.12 
 
 		 254 aa  88.6  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3326  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.14 
 
 		 223 aa  88.6  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.65 
 
 		 224 aa  88.6  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 229 aa  88.2  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 		 230 aa  88.6  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4366  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.66 
 
 		 225 aa  88.6  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  33.05 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.64 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.91 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.62 
 
 		 253 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  26.92 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.63 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  29.03 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5375  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.39 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30.77 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.7 
 
 		 210 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3515  two component LuxR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150532  hitchhiker  0.00248481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0424  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0433  two component LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.6 
 
 		 228 aa  85.9  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 207 aa  86.3  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  28.37 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 223 aa  85.9  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 216 aa  85.9  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 215 aa  85.5  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2743  two component LuxR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 215 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1607  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.67 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  31.46 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  32.06 
 
 		 217 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  31.87 
 
 		 207 aa  85.5  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0992  regulatory protein, LuxR  30.56 
 
 		 218 aa  85.5  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>